De vrouw van rechercheur Yoshitaka Nishi is ongeneeslijk ziek. Als hij haar in het ziekenhuis bezoekt, wordt zijn collega Horibe neergeschoten en raakt verlamd. Verbitterd neemt hij ontslag om met zijn vrouw een laatste reis door Japan te maken.

De film Brother laat de kijker geloven dat de grootste criminelen mensen met de beste manieren kunnen zijn, oftewel gangsters met respect. Yamamoto (Takeshi Kitano) wordt verstoten door zijn Japanse maatjes en gaat in Los Angeles op zoek naar zijn halfbroer. Deze blijkt zich in een onbeduidende ‘gang’ te bewegen van kleine drugshandelaren. Yamamoto ontfermt zich over deze groep en leert hun de kneepjes van het vak, zoals hij deze in Japan heeft opgedaan. Zijn input is zo succesvol dat het vooralsnog onbekende criminele groepje uitgroeit tot een ware criminele organisatie die de straten van Los Angeles domineert. Vol respect voor autoriteiten en elkaar distantiëren zij zich van de typische Amerikaanse gangsters. Maar criminelen zullen zij altijd blijven.

Wanneer een belangrijke gangsterbaas wordt vermoord, krijgt diens sadistische rechterhand Kakihara opdracht de dader op te sporen. Door getuigen aan vreselijke martelingen te onderwerpen, ontdekt Kakihara dat zijn baas werd vermoord door Ichi, een geheimzinnige jongeman die zijn tegenstanders met vlijmscherpe messen in zijn laarzen aan reepjes snijdt.

In september 1971 groef een bende dieven een tunnel onder de Baker Street bank in Londen en ging er vandoor met drie miljoen pond aan juwelen en cash. Niemand werd ooit gearresteerd en de buit nooit teruggevonden.

In een alternatief Japan vormen territoriale straatbendes tegengestelde facties die gezamenlijk bekend staan ​​als de Tokyo Tribes. De sluimerende spanning tussen hen staat op het punt om uit te monden in een totale oorlog.

Als de beeldschone Emu getuige is van een bloedige aanslag op een lid van de Chinese maffia, stelt de dader (de Freeman) zich aan haar voor. Zoals de traditie bepaalt zal zij moeten sterven door zijn hand. Maar als de twee opnieuw oog in oog staan, krijgt de Freeman het niet over zijn hart om haar van het leven te beroven. De triade waar hij voor werkt beschouwt deze actie als verraad en zweert wraak.

Een groep van drie Yakuza's heeft hun baas voor de laatste keer teleurgesteld. Nadat ze een belangrijke baan hebben verknald, geeft hun baas hen twee opties: óf ze plegen eervolle zelfmoord, óf ze gaan naar Thailand om een ​​geslachtsaanpassende operatie te ondergaan en vrouwelijke idolen te worden! De drie beslissen uiteindelijk over het laatste. Nadat ze een jaar lang hun leven hebben gewijd aan het trainen van idolen, volgt hun eerste publieke optreden. En geheel onverwacht genieten de drie idolen een grote populariteit, tot hun eigen schrik uiteraard. En dat is nog maar het begin van de hele tragedie!