Mantan agen FBI Will Sawyer, yang hidup dengan satu kaki karena kaki kirinya diamputasi, tinggal di gedung pencakar langit paling tinggi dan "paling aman" di Hong Kong bersama keluarganya. Suatu hari, gedung tersebut diserang oleh teroris, memaksa Sawyer untuk mengambil tindakan.

Setelah Ratu Jahat menikahi Raja, dia melakukan kudeta yang kejam di mana Raja dibunuh dan putrinya, Putri Salju, ditawan. Hampir satu dekade kemudian, Putri Salju yang sudah dewasa masih berada dalam cengkeraman Ratu. Untuk mendapatkan keabadian, Ratu Jahat membutuhkan hati Putri Salju. Setelah Snow melarikan diri dari kastil, Ratu mengirim Pemburu untuk menemukannya di Hutan Gelap.

Hellboy datang ke Inggris, di mana ia harus mengalahkan Nimue, permaisuri Merlin dan Ratu Darah. Tetapi pertempuran mereka akan membawa akhir dunia, nasib yang dengan putus asa dia coba untuk berpaling.