Sophie is achttien en werkt zich te pletter in de hoedenwinkel die haar vader ooit bezat. Op een uitje naar de stad loopt Sophie de mysterieuze tovenaar Howl tegen het lijf.
In Fujisawa zit Sakuta Azusagawa in zijn tweede jaar van de middelbare school. Zalige dagen met zijn vriendin en upperclassman, Mai Sakurajima, worden onderbroken door de verschijning van zijn eerste verliefdheid, Shoko Makinohara.
Gintoki reist vijf jaar naar de toekomst en vindt een woestenij waarin zijn beschermelingen, Kagura en Shinpachi, uiteen zijn gedreven, en zijn veranderd in geharde vigilantes, terwijl hij zelf al jaren vermist is. Hij herenigt ze om de waarheid te vinden achter de epidemie die Edo teistert, en te ontdekken hoe ze de situatie kunnen herstellen. De sleutel hiertoe blijkt in zijn donkere verleden te liggen, en samen met zijn vrienden confronteert hij zijn verleden en vecht hij voor de toekomst.
Atsuko Chiba is een psychiatrice die geavanceerde technologie hanteert om het brein van haar patiënten te doorgronden. Ze leidt een dubbelleven als Paprika, een high-tech detective die dezelfde technologie gebruikt om te achterhalen wat er in de gedachten omgaat van de mensen die ze zoekt. Wanneer de technologie echter gestolen wordt moet Paprika er snel achteraan, aangezien de hele stad in een golf van psychologische instabiliteit verkeert.
Tijdens een testrit met de Mini Merry vertelt Usopp Brook het verhaal van de Going Merry, een schip dat de bemanning goed van pas kwam. Voor de Straw Hats was de Going Merry echter niet zomaar een schip: het was een onschatbare, onvervangbare vriend. *Scènes zijn opnieuw gemaakt met gloednieuwe animatie.
Na een chaotische overval worden Lupin en Jigen verzorgers van een jongetje, terwijl een jonge luchtpiraat genaamd Yutika uit is op hun buit. Yutika is een inwoner van de stadstaat Shahalta, die onlangs in handen is gevallen van een louche minister. Al snel bundelen de bende van Lupin en Yutika hun krachten om een van Shahalta's grootste schatten te ontdekken, waarbij ze het opnemen tegen zowel de autoriteiten van Shahalta als Zenigata.
Na het accepteren van een uitnodiging van een mysterieuze trainer, ontmoeten Ash, Misty en Brock MEWTWO, een kunstmatig gecreëerde Pokémon die wil vechten.
In de verre technologische toekomst heeft de beschaving zijn ultieme op het internet gebaseerde vorm bereikt. Een "infectie" in het verleden zorgde ervoor dat de geautomatiseerde systemen ontregeld werden, wat resulteerde in een gelaagde stadsstructuur die zich oneindig in alle richtingen repliceert.
Shibuya, Tokio, bruist van het Halloween-seizoen. Er wordt een bruiloft gehouden in Shibuya Hikarie, waar rechercheur Miwako Sato van de Metropolitan Police Department gekleed is in een trouwjurk. Terwijl Conan en de andere genodigden toekijken, stormt er plotseling een aanvaller binnen en raakt rechercheur Wataru Takagi, die Sato probeerde te beschermen, gewond. Takagi overleefde het en de situatie was opgelost, maar in Sato's ogen overlapte het beeld van Magere Hein dat ze had gezien toen rechercheur Matsuda, de man op wie ze verliefd was geweest, drie jaar geleden bij een reeks bomaanslagen was omgekomen, met dat van Takagi.
Het verhaal begint wanneer een middelbare scholier die muziekvideo's maakt een leraar ontmoet die de muziek heeft opgegeven. Asaya Kanata, maker van amateurmuziekvideo's, ziet leraar en muzikant Yū Orie op straat lopen en besluit een videoclip van haar muziek te maken.