Skekseiksi kutsuttujen liskomaisten olentojen rotu on tuhat vuotta aiemmin kaapannut vallan salaperäisen Tumman kristallin avulla. Skeksit ovat ajaneet rauhaa rakastavien mystisten klaanin maanpakoon, sekä tappaneet ihmismäiset gelflingit sukupuuton partaalle. Viimeisiin gelflingeihin lukeutuva Jen on kasvanut perheensä kuoleman jälkeen mystisten parissa. Taivaan kolme aurinkoa ovat kuitenkin jälleen yhdistymässä, joten Jenin on lähdettävä kylästään etsimään Kristallista kauan sitten irronnutta sirpaletta. Tämä on asetettava ajoissa skeksien linnassa olevaan Kristalliin. Jos Jen epäonnistuu, laskeutuu maailman ylle ikuinen pimeys.
Tangalassa on ongelmia: kuningas Neptunuksen kruunu on kateissa, ja johtaja Rapua epäillään sen kähveltämisestä. Hankkiakseen kruunun takaisin ja pelastaakseen johtaja Ravun Paavo Pesusieni suuntaa yhdessä parhaan ystävänsä Patrik Tähtösen kanssa kohti kavalaa Kotilokaupunkia.