2009年，当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）相识的前一年。在美国FBI学成归来的当麻被分在警视厅公安部公安第五课未详事件特别对策系，接受组长野野村光太郎的直接领导。此前不久，某大型石油企业高管接连被人杀害，死者的心脏无一例外都留下被人用手捏过的痕迹。显而易见，这一系列事件和所谓的SPEC持有者有着极为密切的联系。与此同时，石油企业高管Diablo（大杉涟 饰）高薪聘请神秘SPEC持有者一十一（神木隆之介 饰），企图阻挡神秘的SPEC杀手。一十一，这个日后与当麻和濑文有着不解渊源的难缠敌手将当麻视作杀害父母的爆弹女，之后更斩杀了当麻在美国结识的好友Nancy。 SPEC宏大篇章自此拉开序幕，决定世界命运的重大事件也进入了倒计时。
布鲁斯·韦恩（克里斯汀·贝尔 Christian Bale 饰）童年亲眼目睹了父母在高谭市街头被歹徒枪杀，韦恩充满怒火。在继承了父亲亿万家产后，韦恩开始环游世界，希望凭自己的力量复仇和打击犯罪！韦恩为了了解罪犯的心理，在亚洲他亲自体验了犯罪的感觉，最后被捕入狱。他在狱中遇到了武艺高强的杜卡，杜卡传授了韦恩高强的武艺和坚韧的意志力。韦恩很快被神秘的影忍者盟看上，忍者大师一直想邀他加入。韦恩不久发现影忍者盟对自己的家乡高谭市另有企图，他毅然回到了故乡。韦恩在自己的庄园发现了一个地下室，从此他多了一个身份—蝙蝠侠。蝙蝠侠开始了对抗笼罩在高谭市的黑暗。
斯塔克军火公司是美军在全球范围内第一大军火供应商，其新任掌门人托尼·斯塔克风流倜傥，天资聪颖。他与公司元老俄巴迪亚·斯坦合作无间，共同将斯塔克公司的业务推向顶峰。现实生活中的托尼热衷收集名贵跑车，搞点儿发明创造，当然露水姻缘更不可少。所幸他身边有维吉尼亚·波茨这样的好助手细心打理一切，才让他能自由自在过着贵公子的生活。在前往中东为军方展示新型武器的途中，托尼一众遭到恐怖分子袭击。他被弹片击中险些丧命，在英森博士的帮助下，托尼体内移植了一颗核动力的人工心脏。恐怖分子要求托尼制造强大的杀伤性武器，他和英森虚与委蛇，暗中制造了一套由聚变能源驱动的钢铁盔甲。穿上盔甲托尼大闹恐怖分子的基地，回到美国后又对其进行了改进。却不知，接下来有更为黑暗的阴谋等着他……
话说克利顿星球爆炸之前，超人父母将婴儿放入火箭中送到地球，他被一对农家夫妇收养，长大成为记者。当美国遭野心家企图毁灭时，他就跑进电话亭中穿上S型超人制服，变成挽救各种危机的超人。
上世纪 40 年代，纳粹及其邪恶轴心的战火烧遍世界各个角落。居住在布鲁克林的小个子史蒂夫·罗杰斯（克里斯·埃文斯 Chris Evans 饰）心系国家，一心上阵杀敌，可是糟糕的体格让他始终被征兵办拒之门外。偶然的机会，在德籍科学家厄斯金博士（Stanley Tucci 饰）的帮助下，这个小个子男孩得以走入兵营，并接受了博士的试验，化身成为高大健壮、膂力过人的超级战士。与此同时，德国纳粹红骷髅部队的首领约翰·施密特（雨果·维文 Hugo Weaving 饰）依靠超自然的力量建立起一支超级战队，企图称霸全世界。为了营救好友，史蒂夫以美国队长的形象闯入施密特的军营，正邪两大超级战士的战斗就此展开……
童年的一起突发事件，令彼得·帕克和父母生离死别。转眼彼得成为一名高中生，他偶然发现父亲的公文包，并从叔父本处得到线索，于是启程前往奥斯库公司拜访父亲当年的合作伙伴——科特·康纳斯博士。在公司内四处寻找线索的彼得意外被蜘蛛咬了一口，回程途中他的身体发生奇异的变化。在康纳斯博士德引导下，彼得不断了解并发掘体内着超乎寻常的能力，喜怒哀乐，各种意想不到的事情迅速向他袭来。直到某日，他便成了影响深远的超级战士蜘蛛侠。而城市内也出现了凶恶的蜥蜴人，彼得不平凡的人生就此展开。
曾经不修边幅的亚瑟·库瑞，经过了一番磨难和艰苦拼杀之后，终于成为亚特兰蒂斯万众瞩目的海王。如今的他养尊处优，生活富足，与湄拉婚姻幸福，并且育有一个可爱的儿子。当然高高在上的日子也充满无聊和枯燥，直到某一天，贼心不死的黑蝠鲼找到了传说的黑三叉戟，旋即展开针对亚特兰蒂斯的报复。在冲突中，湄拉遭到重伤。在母亲的建议下，亚瑟找回了被自己亲手打败并流放的弟弟奥姆。兄弟二人捐弃前嫌，展开了亚特兰蒂斯的保卫战……
居住在台北的年轻女子露西，被迫成为“人体快递”， 胃里被黑帮植入一种新型病毒，在一次被暴打后，胃里的病毒融入血液，从而使她意外拥有了用意念便可控制周围物体的超能力，比如预见未来、用意念移动物品、消除疼痛、瞬间变身等。她的顽强反抗和逃脱也因此引起非法组织的追杀，在调查非法组织并与之斗争的同时，自己的生命也在迅速走向消亡，在挽救生命、寻找真相的道路上，露西从手无缚鸡之力的弱女子逐渐成长为一名无所不能、无所不在的超级女英雄。
经过多年的潜心研究，培顿博士（连姆·尼森 Liam Neeson 饰）终于研制出了人造皮肤，可是，这种人造皮肤有一个致命的弱点，那就是长时间的阳光照射会使它变质腐坏。一群歹徒盯上了佩顿博士的研究，为了得到这珍贵的发明，他们不惜炸毁了实验室。尽管培顿博士死里逃生，但他的全身皮肤严重毁损已成为了事实。治疗所带来的痛苦和副作用让佩顿博士的内心充满了愤怒，怀揣着复仇的信念，他逃出了医院。利用自己所发明的人造皮肤，佩顿博士有了新的面孔，与此同时，一个新的超级英雄也就此诞生。在罪犯们的眼中，培顿博士是令人闻风丧胆的凶神恶煞，可在昔日爱人的面前，佩顿博士却感受到了久违的悲伤和痛苦。
某富豪过世，他将大部分财产捐给各种慈善机构，只给自己专横跋扈的继女凯丽根·克里坦顿（凯西·莫拉蒂 Cathy Moriarty 饰）留下一幢位于缅因州的别墅。这幢名为维普斯大府庄园的别墅拥有很久的历史，如今早已破败不堪，无法住人。凯丽根起初愤怒不已，但她偶然知晓别墅内可能藏着金银财宝，于是和律师帝布斯（Eric Idle 饰）欣然前往。令他们想不到的是，这里竟然还住着4个幽灵。财宝当前，贪心之人想方设法要把幽灵赶走……
因受到辐射而基因变异的科学家布鲁斯·班纳，仍然在想尽办法寻找能够治愈他那被毒害了的细胞的方法，布鲁斯愤怒的时候，放肆的暴力倾向会让他的身体机能迅速蠕动，变成一个力大无穷、像小山一样高的绿色巨人，可是他不想这样，即使他能够得到神奇的超能力，却宁可过回普通的平淡生活。为了躲避美国军方的追捕，布鲁斯只好把自己藏在隐蔽的地方，与以前的生活、包括他心爱的女人贝蒂·罗斯完全切断了联系，而紧随在他之后的，正是贝蒂的父亲——撒迪厄斯·罗斯将军，这个冷酷的战争机器想要抓住布鲁斯，就是为了研究他身体里产生的异变，然后将这种力量据为己用。后来，“绿巨人”为什么会出现的谜底也渐渐浮出了水面，同样的基因经过复制后，另一个变异人“憎恶”埃米尔·布朗斯基被制造出来了，同样破坏力惊人，却是一个令人讨厌的畸形怪物，将会是“绿巨人”需要对抗的最有威胁性的敌人。与此同时，布鲁斯还必须得做出一个让人苦恼的最终选择：是重新当回普通的科学家，还是继续背负着那个一直隐藏在他内心深处的绿色生物，以求寻找到真正勇敢与侠气并重的英雄气节。
一个曾经号称“拉萨屠夫”（字幕翻译如此，实际上影片中他被称为“黑鹰”）的恶棍拉蒙特（鲍德温）被高僧收服，传他法术，后来他回到30年代的纽约，成了魅影侠，扶危济困，白天却是一副公子哥样子。后来同样是高僧弟子，成吉思汗转世的舒云可汗（尊龙）杀死高僧，夺得了具有魔力的金刚杵（老外觉得那就是个Flying Dagger），来到纽约，准备夺得最新技术研制的原子弹，一举实现成吉思汗遗愿，统治世界。两人都是精于心灵控制的大师，展开了各种奇诡的法术斗争。整个纽约成了一场黑暗战争的战场……
杜夫·龙格尔饰演神出鬼没的正义使者，为了替家人报仇，于五年内单枪匹马干掉一百二十五名黑帮分子，导致法兰哥家族群龙无首。于是帮会邀请在当年下令杀害警察凯索一家而仓惶走避他乡的法兰哥再度出山重振黑帮声威，警方则派出警探伯克维兹追捕正义使者。他怀疑此人就是他以前的警察搭档凯索，在女警莎曼协助下发现惊人内幕。
从小孤苦无依的布鲁斯·班纳长大后成为了美国伯克利军方的科学家，专职从事新型高能炸弹的研究工作，他与罗斯将军的女儿贝蒂·罗斯相恋。事业与感情一帆风顺的布鲁斯似乎已经摆脱了幼年孤独的阴影，走上了一条让人艳羡的成功之路。然而好景不长，在一次试验中，为了保护一名同事，布鲁斯暴露在致命的伽马射线之下，布鲁斯体内的神秘力量被意外唤醒。从此之后，每当情绪激动时，布鲁斯就会失去自我意识，变身成为绿巨人，并且同时具有超强的破坏力和抗拒意志。但布鲁斯并不知道也不想知道自己异于常人的变身能力。对他来说，自己只是一名没有过去、充满困惑的孤独科学家，丝毫不能理解为何会突然招致军方的围捕。面对一系列措手不及的突发事件，布鲁斯的女友贝蒂·罗斯同样感到迷茫无助。她希望帮助布鲁斯，但却遭到负责围捕绿巨人的父亲的阻止。而此时，自称是布鲁斯父亲的神秘人物大卫(尼克·诺尔蒂 饰)出现在罗斯将军身边，他告诫贝蒂不要接近自己的儿子，令贝蒂更感困惑。就在贝蒂思念班纳的同时，罗斯将军所带领的特种军队非但不会同情绿巨人的遭遇，反而早已洒下天罗地网并派出最强大的战士，意欲抓获绿巨人以获知其中的秘密。为了对抗绿巨人的超能力，罗斯将军也有自己的秘密武器，那就是神秘的超能力怪物——“吸收人”(Crusher Creel)。“吸收人”可以变身成为任何自己接触到的物体，与绿巨人势均力敌。而更为惊人的是，“吸收人”其实就是布鲁斯的生身父亲大卫·班纳。由此，布鲁斯的神秘身世开始逐渐清晰起来……
“水妖”的传说在西方家喻户晓，据说那是一群住在海、河或森林中的美丽少女。一栋公寓的门卫克里夫兰（保罗·吉亚玛提 Paul Giamatti 饰）在夜里巡逻时，发现在游泳池里有一位少女，他救她出来，得知她名叫斯托丽（布莱丝·达拉斯·霍华德 Bryce Dallas Howard 饰），原来就是传说中的水妖，正在被怪兽追逐。为了帮助斯托丽回到原来的世界，克里夫兰找来许多大厦住户帮助，也慢慢爱上了这个与众不同的女孩，可惜时间紧迫，斯托丽在这个世界耽搁越久，越会惹来怪兽袭击，甚至开始威胁这个世界人们的生命……
超人又回来了！这次，超人克拉克（克里斯托弗•里夫 Christopher Reeve 饰）回家乡去参加高中同学聚会。聚会上，克拉克重遇了以前就一直心仪的女孩拉娜（安妮特•奥图勒 Annette O'Toole 饰）。爱火重燃的克拉克对拉娜展开了爱情攻势，两人很快就堕入了情网。正当两人浓情蜜意时，发生了一场灾难。本应马上出动的克拉克因为沉浸在和拉娜共处的时光而延误了救灾，导致了更多无辜的人们的伤亡，为此克拉克感到异常的自责。 同时，野心勃勃的巨富利用气象卫星技术控制着世界各地的气候以此牟利，造成了很多地方天灾连连。他心知超人一定会来找自己的麻烦，于是不惜重金又制造出了一个超级电脑机器人用来对付超人。克拉克这次能否最终战胜邪恶？
为了寻找失落于地球的量天仪宝珠，太空城族长扎尔塔（彼德·奥图 Peter O'Toole 饰）派遣女超人卡拉（海伦·斯雷特 Helen Slater 饰）前往地球。此时的宝珠落到了邪恶的女巫赛琳娜（费·唐纳薇 Faye Dunaway 饰）的手中，为了炫耀这价值连城的宝 物，赛琳娜举办了一场晚会，而这就是卡拉夺回宝物的最佳时机。卡拉的举动惹恼了赛琳娜，她设计将卡拉骗至恐怖城，夺走了她的力量与自由。 得知卡拉遇险，扎尔塔前来营救，却不想命丧赛琳娜之手。悲愤的卡拉想方设法逃脱了赛琳娜的桎梏，为了给死去的扎尔塔报仇，为了夺回珠宝，为了维护世界的和平，卡拉做好了准备，要与赛琳娜展殊死搏斗。
约翰亨利（侠客欧尼尔饰）是军方的治金专家，负责一种新型防卫的武器的研发计划：利用「声波」把敌人歼灭，却不必动到一刀一枪：他和神秘的政府高层研究小组合作，小组领导人是精明的女性电子专家史巴克；就在测试武器的当天，由于小组成员桑纳一时疏忽，导致史巴克半身麻痹，约翰亨利在心力交瘁之余，决定回到洛杉矶，永远离开武器的世界。洛城平静的生活维持不久，他竟在一群抢匪身上见到自己创造的武器，原来，桑纳已经离开政府单位，准备将武器高价售予全球最凶残的恐怖份子，约翰亨利必须在歹徒得逞之前阻止他们，而他最先想到能帮他的人就是躺在医院里的史巴克……