تتجول "شيهيرو" في عالم سحري تحكمه ساحرة - تقوم بتحويل كل من يعصيها إلى حيوانات.
كانت هنالك قرية صغيرة لا تكاد ترى يعيش فيها أشيتاكا بهدوء ونعيم. وهذه القبليه هي من القبائل التي قام الإمبراطور بنفيها وحكم عليها بنسيان إلى الأبد وبذلك تنفى هذه القبيلة وتختفي عن الأنظار وهكذا لم يعرف الناس بهم ولم يعرفوا قدرهم ومن قوانين هذه القبيلة أن أي شخص لا يمكنه مغادرتها والذي يغادرها لا يعود أبداً. أشيتاكا هو أميرهم وهو يقوم بحمايتهم جميعاً من المصاعب التي تواجههم في أحد الايام بينما كان أشيتاكا في الجوار مع غزاله الأحمر, صدر صوت غريب يشبه جلبه وفجأة يظهر حيوان غريب كبير وبذلك تتغير حياة أشيتاكا للأبد منذ تلك اللحظة.
بعد حوالي 31 سنة من الحرب العالميّة الثالثة؛ أحد أفراد عصابة كانيدا المدعو بتيتسو اصطدم بطفل ذو قوّةٍ خارقة وتوّرط تيتسو بعد ذلك في مشروع خطير يهدّد مدينة نيو طوكيو بأكملها لكن ما هذا المشروع؟ ومن هو هذا الطفل ذو القوّة الخارقة؟
تدور القصة بعد ألف عام بعد حريق السبعة أيام كانت نهاية الحضارة البشرية وبعدها أصبح البشر يعيشون في مستوطنات منفصلة ومعزولة، لكن بحر الهلاك غابة ضخمة من النباتات والحشرات العملاقة والأبخرة السامة الذي غطى سطح الأرض بالخراب يستمر بالتقدم على سطح الأرض مهددا حياة البشر بالهلاك وقد حاول كثير من البشر إبادة بحر الهلاك إلا أنه وفي كل مرة تظهر أسراب من حشرات الأوهم الثائرة التي سادت في الأرض بسبب أعدادها الكبيرة وقدراتها تهاجم كالأمواج العاتية مدمرة كل ما أمامها دون توقف حتى تموت من الجوع عندها ظهرت الفطريات التي تعيش على جيف كائنات الأوهم والتي كست الأرض في بحر الهلاك والآن تحاول إحدى الممالك المتبقية تدمير بحر الهلاك فتقف أميرة وادي الرياح ناوسيكا في وجههم
تركز السلسلة على مغامرات أراتا كاسوجا ، طالبة في المدرسة الثانوية ، استهدفتها ليليث ، وهي معلمة في مدرسة صوفية. أعطى ثلاثة خيارات في محاولة للمساعدة في إنقاذ ظاهرة انهيار العالم من قبل قوى الشر وأثناء محاولته حل لغز ابن عمه الحبيب وصديق الطفولة ، هجري ، الذي اختفى إلى فضاء مختلف.
ور القصة حول محاولة جيغِن في القضاء على لوبان وتجعله يشعر بالغضب تجاه خيانة صديقه. وتتمحور الأحداث حول مواجهة لوبان وغوِمون وجيغِن.
شيبويا، طوكيو، تعج بموسم الهالوين. يقام حفل زفاف في شيبويا هيكاري، حيث يرتدي المحقق ميواكو ساتو من قسم شرطة العاصمة فستان زفاف. بينما يشاهد كونان والضيوف المدعوون الآخرون، اقتحم مهاجم فجأة، وأصيب المحقق واتارو تاكاجي، الذي كان يحاول حماية ساتو. نجت تاكاجي وتم تسوية الوضع، ولكن في نظر ساتو، تداخلت صورة الحاصد القاتم الذي رأته عندما قُتل المحقق ماتسودا، الرجل الذي كانت تحبه، في سلسلة من التفجيرات قبل ثلاث سنوات، مع تاكاجي.