Sosuke, az 5 éves kisfiú különleges kapcsolata egy aranyhalhercegnővel, aki ember szeretne lenni.

2032-ben az "ember" szó jelentése már nem egyértelmű. Kiborgok, androidok és mechanikus bábuk léteznek egymás mellett. Azok, akik szerves testben élnek, megpróbálják fenntartani az emberiség elhalványult eszményét. Batu kiborg, rendszerében csupán halvány nyoma van eredeti természetének. Társával, Togusával, aki túlnyomó részt ember, nyomozni kezdenek egy sorozatgyilkosság ügyében, amit megvadult androidok követtek el. Nyomozásuk során felderítenek egy örömlánybaba piacot és az őket, a "gynoidokat" előállító kétes vállalkozást. A vad kitörésekre hajlamos Batu megpróbál ragaszkodni annak maradékához, amit a lelkének lehet tekinteni, de kísérti előző partnerének, egy női androidnak, a nyomtalanul eltűnt Őrnagynak az emléke.

A sikeres Playstation játék, a Final Fantasy VII. történetét folytató filmben két év telt el azóta, hogy Midgar romjai a béke megteremtéséért hozott áldozatok örök mementójaként állnak. A világra azonban hamarosan új veszedelem leselkedik: egy viharos gyorsasággal terjedõ rejtélyes betegség. A régi ellenségek is megélénkülnek, így Cloud, aki megannyi hõstett után visszavonult, és a magányos életet választotta, ismét színre kell hogy lépjen - ezúttal ebben az egész estés filmben!