Млада песникиња Роуз Елиот купује књигу у локалној антикварници, на латинском, дневник архитекта, Е. Варели. Учи о “Три мајке”, и почиње да верује да зграда у којој она живи је једна од његових кућа. Она моли свог брата Марка, који студира Музичку академију у Риму, да дође, јер је јако уплашена. Маркова другарица Сара, случајно прочита писмо које је Марк добио од Роуз, које је он случајно заборавио у учионици, сазнаје да је школа вођена на основу Мајке Лакримарум, и убијена због тога сазнања. Кућа Мајке Суспириорум је већ уништена, док Марк дође до Њујорка, сазнаје да му је сестра већ убијена...

Филм сведочи о застрашујућем путовању троје филмаџија кроз шуму Блек Хилса, откривајући ужасне догађаје који су се збивали пред њиховим камерама. Филмаџије још увек нису пронађене. Годину дана након нестанка, пронађен је њихов снимљени материјал. „Пројект: Вештица из Блера“ је њихова оставштина.

Ово је последњи део трилогије «Три мајке» чија се радња одвија у Риму и који је везан за Мајку суза (Mater Lachrymarum) – Трећу мајку. На гробљу у Витербу пронађена је древна урна. Када је отац Бруско отвори, изазива талас насиља у Риму: број пљачака, силовања и убистава се убрзано повећава, док неколико мистериозних жена опаког изгледа долазе са свих страна света у Рим и окупљају се у граду. Сви ови догађаји повезани су са повратком Матер Лакримарум, последње од три моћне вештице које су шириле терор и смрт вековима. Сама против војске вештица и демона, Сара Менди је једина особа која је преостала да спречи Мајку суза да уништи Рим. Она мора да открије своје скривене натприродне моћи уз помоћ духа њене мајке и да се супротстави злој вештици у раскошној палати Варели.