Tamako és Mochizou születésük óta együtt voltak, egymás mellett nőttek fel. Így tehát tanúi lehetünk egy gyönyörű történetnek ahol a gyerekkori barátságból szerelem lesz.

Pecás, Csilla és Dagi egy este megszöknek otthonról és a tengerparton egy hóbortos tudós elrejtett laboratóriumára bukannak. Mindenféle kotyvalékok fortyognak az asztalon, a legkülönösebb az az itóka, amely tengeri élőlényekké változtatja az embert. Hogy, hogy nem, egy csepp bizony lecsúszik a szegény kis Csilla torkocskáján, és rögvest magával ragadja egy hívatlan hullám. Bátyja önszántából követi a kis tengeri csillagot halacska képében, és kis csapatuk hamar kiegészül a medúzává változott Dagival, okulárés unokatestvérükkel. A varázslat ellenszere is valahol a tenger mélyén pihen, ezt kell felkutatniuk hidegvérűvé vált hőseinknek, míg a víz felett a lelkiismeretfurdalástól gyötört Krill professzor és a kétségbeesett szülők próbálkoznak a lehetetlennel, megtalálni három pici lényt a hatalmas tengerben.

Ash Ketchum és színes társasága ismét nagy próbatétel elõtt áll. Lawrence III, a repülõ gépezetén száguldozó kapzsi Pokémon-gyűjtõ káoszt teremt a Világegyetemben azzal, hogy felbontja a természet egyensúlyát. Elrabolja a három Pokémon madarat, (Moltres, Zapdos és Articuno) amely a tüzet, villámot és a jeget uralja. Hamarosan Lugia, a tengeri Pokémon is a gonosz áldozatává válik. Ash, Misty és a többiek gyorsan akcióba lépnek, hogy megakadályozzák a teljes pusztulást... A Pokémonok második egész estés filmje is kalandos perceket szerez a rajongók táborának.

40 évvel korábban egy nagyon gonosz Pokémon vadász majdnem elkapja Celebit, ám egy megfigyelő megmenti. Celebi félelmében a jövőbe utazik, ahová magával viszi megmentőjét is. Ash és barátai épp annak az erdőnek a határában járnak, ahol megnyílik az időkapu és megérkezik Celebi fiatal barátjával. A fiút sikerül megmenteniük, ám Celebit elkapja a Rakéta csapat egy sötét pokélabda segítségével, melynek hatására Celebi gonosszá és legyőzhetetlenné válik. Az erdő és a környék veszélybe kerül, Celebi mindent elpusztít, ami az útjába kerül.