Fiona un Šreks atgriežas no medusmēneša. Viņus sagaida vēstule no Fionas vecākiem ar uzaicinājumu ierasties ciemos. Kopā ar pļāpīgo un brīžiem burtiski neizturamo Ēzeli jaunlaulātie dodas ceļā uz tālo karaļvalsti. Taču ne karalienei, ne karalim līdz jaunlaulāto ierašanās brīdim nav ne jausmas, kāds izskatās viņu jaunais znots un cik ļoti viņu mazā meitiņa ir... hmm... izmainījusies.
Kad Šreks apprecēja princesi Fionu, kļūt par Tāltālās karaļvalsts karali nebija viņa plānos. Bet kad viņa sievastēvs - karalis Herolds saslimst, Šreka rokās ir atrast piemērotu kandidātu karaļa tronim vai arī viņam pašam nāksies atteikties no klusās un mierīgās dzīves purvā, lai kāptu tronī. Kopā ar labākajiem draugiem - Ēzelīti un Runci Zābakos - Šreks dodas ceļā, lai uzmeklētu to, kurš, viņaprāt, būt karaļa troņa cienīgs.
Jautrību mīlošā un jaunā princese Alise ir spiesta trenēties būt perfektai, lai kļūtu patiesi karaliska. Tomēr patiesībā viss, ko viņa vēlas, ir kļūt par pirātu. Viņa ar Lordu Rodžersu, vardi Žanu-Bobu un bruņurupuci Spīdu paceļ buras, lai dotos pārdrošā jūras braucienā. Kad kuģa avārija komandai liek izglābties uz vientuļas un noslēpumainas salas, draugi liek galvas kopā, lai izbēgtu no izsalkušajiem salas iemītniekiem.