Lenge før han begynte å jakte på terrorister var Mitch Rapp en talentfull idrettsutøver, men etter at Rapp opplever en stor tragedie blir han rekruttert til nasjonens mest hemmelige operasjonsprogram. Etter å ha fullført et treningsprogram, som er designet for å lære bort de nødvendige ferdighetene som kreves for å uskadeliggjøre landets farligste fiender, er han en gjenfødt mann på et hevnoppdrag.

Alt ser ut til å være fryd og gammen på sultanens slott i byen Agrabah. Jafar er jo innestengt i lampen som er gravd ned i ørkenen. Men våre venner vet ikke at Jafar og papegøyen hans Jago planlegger en forferdelig hevn. De vil overta makten i hele Agrabah. Og plutselig en mørk kveld finner en liten tyv en mystisk, fortryllet lampe som er svart som natten…

Fra fjellene i Sentral-Asia til ørkenen i Egypt, gjennom overfylte gater i Paris til havet under nordpolen, kjemper et team av elitesoldater kalt G.I. JOE. I dette actionfylte oppdraget bruker soldatene det siste av neste-generasjons-spionutstyr og militærteknologi for å bekjempe den slue våpen handleren DESTRO og den økende trusselen fra den mystiske organisasjonen COBRA som kan føre verden ut i det totale kaos.

Da Tokyos guvernør blir myrdet, tar den tidligere CIA-agenten Travis Hunter opp jakten på terroristene som er skyldige i mordet. Imidlertid er sammensvergelsen for å drepe guvernøren bare toppen av et isfjell med korrupsjon og vold. Hunter avslører en plan til en blivende Yakuza-leder om å bygge opp et enormt nettverk for narkotikahandel med den kinesiske mafiaen. Tiden løper fra dem, men Yakuza er fast bestemt på å gjennomføre planen. Hunter må dermed forsøke å forpurre planen -og komme seg ut av det med livet i behold.