Sakuta Azusagawa é um aluno do secundário na cidade Fujisawa. Os dias felizes com a sua prestigiosa namorada, Mai Sakurajima, são interrompidos pela aparição da sua primeira paixão, Shoko Makinohara.

O que aconteceria se Shiroyasha nunca tivesse existido? Edo é lançada ao caos por uma causa misteriosa. Sakata Gintoki agora vive em um mundo onde o futuro foi alterado, sem ele. O que aconteceu com o Yorozuya? Gintoki, que agora é um fantasma do passado, deve voltar a carregar o fardo a fim de salvar seus amigos. Ele deve terminar o trabalho mais importante da sua vida, o que pode ser o trabalho final do Yorozuya.

Em um mundo alternativo, mas misteriosamente similar ao nosso, o Japão perdeu a 2.º Guerra Mundial… não aos americanos, mas para a Alemanha nazista. O país então caiu num estado de pobreza e de abandono. A população tornou agitada e a policia se tornou uma força política fascista. A maior ameaça ao governo é um grupo terrorista chamado “A Seita”. Para combater estes terroristas é criado uma divisão especial com unidades blindadas. Um homem desta divisão especial, Fuse Kazuki, é posto em uma situação em que ou mata uma jovem ou é morto. A decisão tomada afetará cada aspecto de sua vida a partir de então.

Os Chapéu de Palha contam a Brook as suas Durante uma pausa na viagem, os Chapéu de Palha andam a vaguear pelo Thousand Sunny. Usopp, Chopper, e Brook saem para explorar o oceano em volta. Brook faz perguntas sobre Merry, uma vez que se juntou à tripulação depois de já terem o Sunny, Usopp e Chopper falam-lhe do seu antigo navio.

A história desenrola-se num mundo repleto de desespero após ter sido devastado por um veneno chamado “Shinobi”, que chegou ao mundo através de um asteroide. As pessoas fogem para “Kairiku”, um refúgio que costumava estar no fundo do oceano e onde se tentam proteger dos efeitos do veneno. Mas ainda existe uma esperança…

Após aceitarem o convite de um treinador misterioso, Ash, Misty e Brock deparam-se com Mewtwo, um Pokémon artificialmente criado que deseja combater.

A história passa-se num futuro distante, onde os seres humanos restantes vivem dentro de um perigoso e gigantesco labirinto chamado de "Mega Estrutura", que ficou totalmente fora de controle. No meio disso tudo, conhecemos Killy, um homem misterioso e de poucas palavras que está determinado a salvar a humanidade do esquecimento.