Després d’anys apartats del món humà, els germans Tortuga decideixen començar a fer heroïcitats per ficar-se a la butxaca els habitants de Nova York i ser acceptats com a adolescents normals. La seva amiga April O'Neil els ajudarà a enfrontar-se a un misteriós sindicat del crim, però aviat es veuran superats per l'atac d'un exèrcit de mutants que els cau damunt.
