Rikosetsivä Nishi (Takeshi Kitano) vierailee vaimonsa (Kayoko Kishimoto) luona sairaalassa. Samaan aikaan hänen työparinsa ja ystävänsä Horibe (Ren Osugi) jää yksin tarkkailemaan rikollisen asuntoa. Nishi saa kuulla, että hänen vaimonsa on parantumattomasti sairas – ja heti tämän jälkeen, että hänen ystäväänsä on ammuttu.
Hideo Yamamoton Ichi the Killer -mangan päähenkilö on lapsena kiusattu ja itsesäälissä rypevä nörtti. Hypnoosin avulla hänestä tulee Japanin alamaailman häikäilemättömin ja sadistisin tappaja. Kun shinjukulaisen yakuza-ryhmittymän päällikkö katoaa mukanaan miljoona jeniä, hänen lävistyksiin hurahtanut kakkosmiehensä, albiino sadomasokisti Kakihara käynnistää massiivisen ihmismetsästyksen jonka kohteena on salaperäinen sadistitappaja Ichi. Jäljitys ulottuu kriminaalikonttoreihin, seksiklubeihin ja muihin hämäräperäisiin paikkoihin.