अस्सी के दशक की किशोरी मार्टी मैकफली को गलती से 1955 में वापस भेज दिया गया था, अनजाने में अपने माता-पिता की पहली मुलाकात में खलल डालने और अपनी माँ की रूचि को आकर्षित करने के लिए। मार्टी को अपने माता-पिता के रोमांस और - अपने सनकी आविष्कारक दोस्त डॉक ब्राउन की मदद से - 1985 में वापस लौटने से इतिहास को हुए नुकसान की मरम्मत करनी चाहिए।
वर्ष 2035 में, जेम्स कोल ने अनिच्छा से स्वयंसेवकों को एक घातक वायरस की उत्पत्ति की खोज के लिए समय पर वापस भेजने के लिए दोषी ठहराया, जिसने पृथ्वी की लगभग सभी आबादी का सफाया कर दिया और बचे लोगों को भूमिगत समुदायों में मजबूर कर दिया। लेकिन जब कोल को गलती से 1996 के बजाय 1990 भेज दिया जाता है, तो उसे गिरफ्तार कर लिया जाता है और एक मानसिक अस्पताल में बंद कर दिया जाता है। वहां उसकी मुलाकात मनोचिकित्सक डॉ. कैथरीन रेली और रोगी जेफरी गोइन्स से होती है, जो एक प्रसिद्ध वायरस विशेषज्ञ का बेटा है, जिसके पास रहस्यमय दुष्ट समूह, 12 बंदरों की सेना की चाबी हो सकती है, जिसे हत्यारे की बीमारी को दूर करने के लिए जिम्मेदार माना जाता है।
अपने लोगों के साथ फ्लोरिडा के लिए उड़ान भरने के बजाय, केविन न्यूयॉर्क में अकेले ही समाप्त हो जाता है, जहां उसे अपने पिता के क्रेडिट कार्ड के साथ एक होटल का कमरा मिलता है- एक क्लर्क और मेडलिंग बेलबॉय की समस्याओं के बावजूद। लेकिन जब केविन अपने पुराने नीमेस, वेट बैंडिट्स में चलता है, तो वह क्रिसमस की पूर्व संध्या पर एक खिलौने की दुकान को लूटने की अपनी योजना को विफल करने के लिए दृढ़ होता है।