For venner og familie er Cody Banks en helt vanlig tenåring. Han elsker å skate, hater matte og føler seg komplett ubrukelig i nærheten av jenter. Men Cody har en hemmelighet; han deltar i et spesialprogram for tenåringsagenter i den amerikanske etterretningsorganisasjonen CIAs regi. Cody lever enhver tenårings drømmetilværelse. Han kjører bil like stødig som en stuntmann, har et avsindig arsenal av kule duppeditter, og hans mentor Ronica Miles i CIA er den dama! Men Codys trening blir utsatt for den store prøvelsen når han skal forestille en ordinær skoleelev og gjøre seg til venns med superdeilige Natalie Connors. Oppdraget består nemlig i å spionere på Natalies far, en vitenskapsmann i ferd med å utvikle en dødelig flåte av "nanoboter" med krefter nok til å ødelegge planeten.

Alcatraz, tidenes mest beryktede fengsel, er gjenåpnet. På vente av dødsstraff sitter en forbryter som vet hvor gull for 200 millioner dollar er gjemt. En gruppe, ledet av den skumle Donny, har ikke tenkt å la ham ta med seg hemmeligheten i graven, og greier å storme det hypermoderne fengselet. Samtidig har FBI-agenten Sascha, som har gått undercover i fengselet, en vanskelig oppgave foran seg. Han må få hjelp av fangen Nick til å prøve å overbevise de hardbarkete fangene om at de må stoppe inntrengerne før de kan myrde en høyesterettsdommer som har blitt tatt til fange. Det store spørsmålet er hva som kommer til å skje når Donny og Sascha møtes ansikt til ansikt.