يدرك أحد قراصنة الكمبيوتر أن ما يعتبره معظم الناس واقعًا هو في الحقيقة محاكاة يتم إنشاؤها بواسطة آلات، فينضم إلى المتمردين ليتحرر.
جون رامبو المقاتل السابق في قوات العمليات الخاصة الأمريكية، وأحد أبطال حرب فيتنام، يعود بعد تقاعده، وحصوله على وسام شجاعة، يذهب في زيارة لأحد أصدقائه في واشنطن، ويعلم مأمور البلدة تيزل بوجوده، وهو يكن له عداء قديمًا، فيقوم باستفزازه، وتوجيه السباب له؛ مما يثير غضب رامبو، فيقوم بسبه وضربه، فيصدر المأمور أمرًا بسجنه، فيهرب إلى الغابات القريبة، ويعلم قائده السابق تروتمان بالأمر، فيحاول تداركه.
في لوس أنجلوس ، عصابة من لصوص البنوك يطلقون على أنفسهم اسم الرؤساء السابقون يرتكبون جرائمهم وهم يرتدون أقنعة ريغان وكارتر ونيكسون وجونسون. مكتب التحقيقات الفدرالي يعتقد أن أعضاء العصابة يمكن أن يكونوا متصفحي الأمواج ويرسلون العميل الصغير جوني يوتا متخفيًا على الشاطئ للاختلاط مع راكبي الأمواج وجمع المعلومات.
يصبح (نيو) آخر آمال البشر، فهو الوحيد القادر على فعل المعجزات، ويحاول (نيو) أن ينقذ مدينة زيون التي سوف تقع قريبًا تحت حصار الآلات. يضع الجميع بقيادة (مورفيوس) ثقتهم الكاملة في (نيو)، ويعلقون عليه الآمال بإنهاء الحرب مع الآلات، لا سيما وهم مؤمنون بالنبوءة التي تتوقع نجاحه. يقرر (نيو) وحبيبته (ترينتي) مرافقة (مورفيوس) إلى الماتريكس لمحاولة الوصول إلى قلب النظام عن طريق صانع المفاتيح. في الوقت ذاته ينجو العميل (سميث) من الإلغاء، ويصبح أكثر قوة عن ذي قبل، ويضع نصب عينه هدفًا أساسيًا هو ملاحقة (نيو).
يكتشف نيو (كيانو ريفز) أنه بطريقة ما قادر على استخدام قوته في العالم الحقيقي، وأن عقله باستطاعته التحرر من جسده؛ ولذلك يجد نفسه إذ فجاة محاصرًا في محطة قطار ما بين العالم الحقيقي والماتركس. في أثناء كل هذا تستعد زيون (ريني ناوفاهو) لحرب شعواء ضد الماكينات رغم صعوبة فوز زيون بتلك الحرب. وبين هذا وذاك لا يعلم كلا الطرفين أن هناك طرفًا ثالثًا يسعى للقضاء على العالم كله.
توم لودلو هو ضابط شرطة محبط من أوهام لوس أنجلوس ، ونادرًا ما يلعب وفقًا للقواعد ويطارده وفاة زوجته. عندما تشير الأدلة إلى تورطه في إعدام ضابط زميل ، يضطر إلى مواجهة ثقافة الشرطي ، حيث كان جزءًا من حياته المهنية بأكملها ، مما دفعه في النهاية إلى التشكيك في ولاءات كل من حوله.
إنه تقاطع مزدوج كبير عندما يتعاون ضابط الشرطة السابق بريان أوكونر مع صديقه السابق رومان بيرس لنقل شحنة من الأموال "القذرة" لتاجر الاستيراد والتصدير المشبوه في ميامي كارتر فيرون. لكن الرجال يعملون بالفعل مع العميلة السرية مونيكا فوينتيس لإسقاط فيرون.