O agente especial dos Estados Unidos, Leon S. Kennedy, entra furtivamente em um pequeno país do Leste Europeu para verificar os rumores de que armas bio orgânicas (B.O.W.s) estão sendo usadas na guerra. Logo após a sua infiltração, o governo dos EUA ordena-lhe que saia imediatamente. Determinado a descobrir a verdade, Leon ignora a ordem e entra no campo de batalha para acabar com a cadeia de tragédias causadas pelas B.O.W.s.

Uma menina chamada Chloe cresce numa casa abandonada, sonhando com o mundo lá fora e imaginando como seria se tivesse uma mãe. O seu pai, um homem perturbado, avisa-a que os “maus” os matarão se ela alguma vez sair de casa. Atormentada por intrusos horrendos que se materializam no seu armário e instada a explorar o exterior pelo misterioso Sr. Cone de Gelado, Chloe acaba por conseguir arranjar coragem para fugir, para descobrir que o pai não estava a mentir. Agora tem de decidir se quer esconder-se para sempre ou lutar por aquilo que mais deseja: encontrar a sua mãe.

Um grupo de cientistas dirigido pelo Dr. Will Caster e pela sua esposa, Evelyn, com o apoio do Governo dos EUA, trabalha na criação de uma inteligência artificial verdadeiramente autónoma e semelhante ao ser humano. No entanto, a sua busca levanta sérias questões éticas e morais, incomodando muita gente. Assim, após um atentado e diante da morte, Evelyn resolve dar o passo decisivo e transpor todas as memórias, consciência e personalidade do marido para um super-computador onde todos vinham trabalhando, de forma que, após a morte dele, a inteligência artificial criada se assemelhe em tudo ao seu criador.