„Suzume” to opowieść o dojrzewaniu 17-letniej głównej bohaterki. Animacja rozgrywa się w różnych dotkniętych katastrofą miejscach w całej Japonii. Podróż Suzume rozpoczyna się w spokojnym miasteczku w Kyushu (południowo-zachodnia Japonia), kiedy spotyka chłopaka, który szuka tajemniczych drzwi. Suzume znajduje je zniszczone pośród ruin, jakby były osłonięte przed jakąkolwiek katastrofą. Suzume zdaje się być przyciągana przez ich moc i sięga aby je otworzyć… Drzwi zaczynają otwierać kolejne drzwi w całej Japonii, siejąc zniszczenie. Suzume musi zamknąć te portale, aby zapobiec dalszej katastrofie.
Historia filmu zaczyna się, gdy Arata nieumyślnie dotyka „Hermes Apocrypha”, grymuar Lilith. Nagle otula go jasne, białe światło, a przed nim pojawia się dziewczyna. Nazywa siebie Lilim i traktuje Aratę i Lilith jak swoich rodziców. W tym samym czasie gdy się pojawia, na świecie coś się zmienia. Zakazana Wieczna Biblioteka budzi się. W Bibliotece jest zapieczętowany ostateczny punkt kulminacyjny Alchemii, Biały Władca Demonów. Biały Władca Demonów planuje wyeliminowanie Araty i Trójcy Siódmej, aby przejąć pozycję Władcy Demonów. Najeżony niewypowiedzianą mocą Biały Lord Demonów atakuje Aratę i wywołuje desperacki kryzys, w którym Arata i Trójca Siódemka muszą uratować świat w tej ostatniej bitwie.
Ash rusza z pomocą uwięzionej matce i córce profesora Hale. Na jego drodze staje Unown, tajemniczy pokemon posiadający moc zamiany myśli w rzeczywistość.