Jeanne d'Arcin kärsimys on periksi antamaton ja puolueeton elokuva. Se ei romantisoi historiaa, muokkaa henkilöhahmoja mieleisikseen tai ota kantaa siihen, mikä Jeanne pohjimmiltaan oli: Jumalan valittu, jollain tapaa mielisairas vai johdateltavissa ollut tyttörukka. Katsoja saa päättää itse. Katolinen kirkko hyökkäsi rajusti elokuvaa vastaan, ja useassa maassa se joutui sensuurin hampaisiin.
Tapahtumat sijoittuvat idylliseen Radegundin vuoristokylään, jonka sopuisassa kyläyhteisössä Franz elää maanviljelijän yksinkertaista elämää kolmen pienen tyttärensä, vaimonsa ja tämän sisaren kanssa. Kun natsi-Saksa vyöryy Itävaltaan ja maan hallinto aloittaa yhteistyön Hitlerin kanssa, myös Radegundin miehiä kutsutaan sotajoukkoihin. Franz ei vakaumuksensa vuoksi voi taistella natsien puolesta ja hän päättää kieltäytyä aseista. Koska Franz ei pysty vannomaan uskollisuutta Hitlerille, hänet vangitaan odottamaan oikeudenkäyntiä. Franzin ollessa vangittuna, perheen elämä Radegundin kylässä vaikeutuu, kun kaikki kyläläiset halveksivat heitä Franzin päätöksen vuoksi. Fani ymmärtää miestään, puolustaa häntä ja yrittää saada tälle oikeutta. Franz pitää kiinni periaatteestaan, vaikka rangaistuksena on kuolemantuomio.