33 rokov našej éry. V rímskej provincii Judea záhadný tesár menom Ježiš Nazaretský začína oznamovať príchod „Božieho kráľovstva“ a obklopuje ho skupina skromných rybárov: apoštolov. Po stáročia očakávali Židia príchod Mesiáša - prozreteľnej osobnosti, ktorá by oslobodila svoju posvätnú vlasť a založila nový poriadok založený na spravodlivosti. Ježišovo učenie priťahuje veľké množstvo stúpencov, ktorí Ho poznajú ako Mesiáša. Sanhedrin, ktorý je znepokojený situáciou, za pomoci Judáša Iškariotského, jedného z dvanástich apoštolov, zatýka Ježiša. Obvinený z vlastizrady proti Rímu, Kristus je odovzdaný Pontius Pilátovi, ktorý ho kvôli nepokojom odsudzuje, aby zomrel ako kriminál na kríži.
Mladí manželia Mária (Keisha Castle-Hughes) a Jozef (Oscar Isaac) sú na nebezpečnej ceste zo svojej domoviny Nazaretu do Jozefovho rodiska Betlehema, aby sa pri sčítaní ľudu, nariadenom kráľom Herodesom (Ciarán Hinds), dali zapísať. Cesta dlhá viac než 150 kilometrov vedie nehostinnými pustinami a je pre oboch o to ťažšia, že Mária je už v deviatom mesiaci tehotenstva...
Syn Boží je prerozprávanie Nového zákona, prevažne putovanie Božieho syna Ježiša Krista a jeho učeníkov, od panenského počatia panny Márie, Ježišových prvých zázrakov a získavanie tisícov nasledovníkov, až po Spasiteľovo ukrižovanie, následné zmŕtvychvstanie a zakladanie kresťanskej cirkvi Pavlom z Tarzu...
Ježišovi sa sníva sen o stredovekej bitke, v ktorej vojaci vykrikujú jeho meno. Ježiš sa prebudí a nechápe, čo mal ten sen znamenať. Veď on je len obyčajný tesár - tak ako jeho otec. Spolu si hľadajú prácu. Časy sú ťažké. Aj Jozef sa celý znepokojený sám seba pýta, kedy už bude koniec utrpenia jeho národa. Je netrpezlivý: Kedy už začne Ježiš konať? Odkedy sa narodil, nezjavilo sa už žiadne znamenie. Lenže Jozefova náhla smrť zmení Ježišov život. Vie, že sa musí vydať na cestu - tvrdí, že svoj život nežije len sám pre seba. Stáva sa vyvoleným, stáva sa mesiášom, stáva sa tým, ktorý dokáže zmeniť vodu na víno.
V roku 1936, v malom nemenovanom meste, sa odohráva príbeh, v ktorom sa časť americkej mládeže začala pohupovať na vlnách marihuanového opojenia. Rodičia stredoškolákov sú pozvaní do školy, aby si vypočuli prednášku lektora o blížiacej sa drogovej nákaze, ktorá sa rozšíri medzi študentmi. S neprehliadnuteľným fanatizmom sa snaží presvedčiť rodičov o potrebných opatreniach, ktoré majú zastaviť záhubu ich detí ...