Nueva aventura de los animales más famosos del Zoo de Central Park (Nueva York), que se sitúa tras los acontecimientos de "Madagascar" y "Madagascar: Escape 2 Africa". "Merry Madagascar" comienza cuando Papá Noel y su trineo aterrizan de forma inesperada en la isla, causando amnesia a Santa Claus. Ahora corresponderá a Álex, Marty, Melman y Gloria (junto con los cada vez más inventivos Pingüinos) entregar los regalos y salvar la Navidad. Y como el trineo no está dañado, podría ser capaz de hacer un pequeño viaje a Nueva York y así regresar finalmente a su amado hogar. (FILMAFFINITY)

El especial comienza con un número musical que muestra que la Escuela Primaria Beansboro se cancela por el día debido a una nevada de siete pulgadas. Mientras que los adultos se quejan incesantemente en la canción sobre los problemas que tienen que enfrentar debido a la nieve y el hielo, los niños disfrutan la oportunidad de jugar afuera con la nieve.

Pac resuelve un misterio sobre sus padres e impide que se lleve a cabo el plan de Betrayus de capturar a Santa Pac, en el día más feliz del año.