يبحث قائد (الديسيبتكانز) عن حجرة خارقة تعطي حاملها قوة بناء أقوى جيش في المجرة، والوحيد الذي يمكنه الوصول إلى هذه الحجرة لوقف (الديسيبتكانز) هو (سام) وهو طالب بالجامعة، وصديقته (ميكايلا)، فهل سينقذ العالم قبل أن تقع الحجرة في أيدي (الديسيبتكانز)؟
للعثور على الحقيقة ، يجب أن تؤمن. بعد ست سنوات من أحداث خاتمة سلسلة ملفات X ، أصبحت عميلة مكتب التحقيقات الفيدرالي السابقة الدكتورة دانا سكالي الآن طبيبة في مستشفى سيدة الأحزان ، وهو مستشفى كاثوليكي ، وتعالج صبيا يدعى كريستيان مصابا بمرض ساندهوف ، وهو حالة دماغية نهائية. يصل عميل مكتب التحقيقات الفيدرالي طبل لطلب مساعدة سكالي في تحديد مكان فوكس مولدر، الرئيس السابق الهارب لقسم ملفات X ، ويقول إنهم سيلغون مطاردته إذا كان سيساعد في التحقيق في اختفاء العديد من النساء ، بما في ذلك عميلة مكتب التحقيقات الفيدرالي الشابة مونيكا بانان. يتم استدعاء مولدر وسكالي مرة أخرى إلى الخدمة من قبل مكتب التحقيقات الفيدرالي عندما يدعي كاهن سابق أنه يتلقى رؤى نفسية تتعلق بعميل مختطف.