Uma aventura que se passa vários anos depois de "Maléfica" - em que o público aprendeu sobre os eventos que endureceram o coração da vilã mais famosa da Disney e a levou a amaldiçoar a pequena princesa Aurora, "Maléfica II" continua a explorar a relação complexa entre a fada de chifres e a quase rainha, ao formarem novas alianças e enfrentarem novos adversários na sua luta para proteger os mouros e as criaturas mágicas.

Duas bruxinhas gêmeas foram separadas no nascimento, adotadas por famílias diferentes quando ainda eram bebês, se reencontram no dia em que completam 21 anos e descobrem que seus misteriosos poderes mágicos ficam mais fortes ainda quando estão juntas. O que elas não sabem é que estão prestes a salvar o mundo de um grande mal, usando suas incríveis habilidades.

As vidas de Keiichi e de Belldandy estavam prosseguindo de forma agradável até que Celestine (velho mentor de Belldandy) aparece em cena. Tendo escapado de sua prisão, Celestine deseja acabar com o corrupto sistema criado por Deus e criar uma nova ordem baseada em sua própria concepção. Mas para isso, necessitará da ajuda de Belldandy. A resposta para tudo encontra-se escondido e esquecido dentro de suas memórias. Após iniciar seus planos contra o Paraíso, Skuld e Urd tentarão para-lo, tanto para conservar o Paraíso quanto o amor entre Keiichi e Belldandy.

Até em Manhattan a magia está em todo o lado. Balthazar Blake, um feiticeiro moderno sem mãos a medir na luta contra as forças do Mal, terá de pegar em Dave Stutler, um estudante de física aparentemente mediano, e ensinar ao relutante recruta a arte e a ciência da magia. Mal sabe Dave que a magia pode ser a chave para derrotar uma feiticeira do mal e conquistar a rapariga.

Wendy Darling, uma menina que procura evitar o colégio interno, conhece Peter Pan, um menino que se recusa a crescer. Com os seus irmãos e Sininho, uma pequena fada, ela viaja com Peter até ao mundo mágico da Terra do Nunca. Lá, encontra o Capitão Gancho, um capitão pirata e embarca numa aventura emocionante e perigoso que irá mudar a sua vida para sempre.

Um feiticeiro maléfico, servo de Satanás, vem para a Terra com a missão de, com a ajuda de seis cristais mágicos, abrir o caminho para o Anticristo e dar início ao reinado do Mal sobre o mundo. Porém, ele precisa contar com a oposição dos Druidas, uma decadente ordem de bruxos cuja missão é impedir que isso aconteça e vai tentar treinar dois jovens, os últimos dos Druidas, para o enfrentarem.

A precisar de uma mudança na sua vida, Kate Forster (Bullock) decide deixar os subúrbios do Illinois e mudar-se para Chicago. A única coisa que lamenta é ter de deixar a bela casa da lagoa que tinha alugado. Ao partir, deixa uma nota para o novo inquilino, para que lhe reenvie o correio. Começa a receber correspondência de Alex, um arquitecto frustrado que se mudou para a casa, e entre os dois nasce uma forte relação. Mas algo está errado. Kate percebe que, na realidade, Alex viveu na casa e está a escrever-lhe dois anos antes...