Radnja filma događa se u postapokaliptičnom svijetu gdje su ljudi nestali, a svijetom vladaju strojevi. Pojavljuje se '9', koji uvjerava ostale preživjele da se ne trebaju skrivati, već trebaju preuzeti inicijativu. Da bi preživjeli, moraju otkriti zašto ih strojevi žele istrijebiti i tako pokušati spasiti civilizaciju.

U nastavku filma Ace Ventura ponovno nastupa kao najpoznatiji svjetski detektiv za nestale životinje. Najnoviji slučaj, nestanak rijetkog afričkog bijelog šišmiša izvlači ga iz duhovnog oporavka u tibetanskom hramu nakon tragičnog završetka njegovog posljednjeg slučaja.

U potrazi za davno izgubljenim bojnim brodom iz građanskog rata s tajnim teretom, kojeg lokalno stanovništvo naziva "Brodom smrti", Dirk i njegov duhoviti pomoćnik Al Giordino (Steve Zahn) upoznaju dr. Evu Rojas (Penelope Cruz), prelijepu i genijalnu doktoricu koja vjeruje da je tajanstveno blago povezano s puno većim problemom koji predstavlja prijetnju cijelom svijetu. U potrazi za brodom, za kojeg nitko ne vjeruje da postoji, Dirk, Al i Eva moraju se uzdati u svoju domišljatost i hrabrost ne bi li uspjeli nadmudriti opasne vojskovođe, preživjeti u opasnoj zemlji i naposljetku razriješiti tajnu.