Animacinio filmo „Egipto princas” siužeto centre – biblijinė istorija apie pranašą Mozę. Tai romantiškas nuotykių ir stebuklų kupinas epas apie vergo sūnų Mozę, išaugusį galingojo faraono Seti rūmuose kartu su išdidžiuoju princu Ramziu, pamilusį nuostabiąją Tziporą, išlaisvinusį iš vergijos hebrajų tautą ir išvedusį ją į Pažadėtąją žemę.
Filmo siužetas nukels į XX amžiaus devinto dešimtmečio pradžią. Paauglys Džudas gyvena kartu su savo motina Vermonte. Naujųjų metų vakarą Džudas linksminasi vakarėlyje su geriausiu draugu Tedžiu ir tėvo draugės dukra Elaiza. Netikėtai linksmybės baigiasi tragiškai – Tedas miršta perdozavęs narkotikų. Sunkiai išgyvendamas draugo netektį, Džudas vyksta į Niujorką, kad atnaujintų seniai prarastus ryšius su tėvu. Čia jis susipažįsta su netikru Tedžio broliu ir susidraugauja su jo bičiuliais muzikantais.