令人感到十分讽刺的是，假面骑士灭亡迅雷再次成为了人类的敌人。 哉亚日本公司发生了大规模爆炸事件，而罪魁祸首竟然是灭亡迅雷站？面对新闻发布会上记者的质问，刃唯阿表示暂不做任何回应。上级也在不断施压，假面骑士巴尔坎（不破谏）与假面骑士瓦尔基里（刃唯阿）不得不做出抉择。 理解人类和修码吉亚两方立场的不破谏与刃唯阿，都有各自的坚持，是为了守护所有生命而战？还是为了自己的规则而战？ 他们与假面骑士灭亡迅雷之间的战斗究竟结果如何——！？
世界上第一个“完美”的人工智能开始表现出惊人的和令人不安的突发行为，当记者开始与科学家谁创造了它。
在大洋中央的一个军事哨所服役两年后——四名士兵正在等待新船员来接替他们。 当期待已久的船终于出现时，船上空荡荡的，没有浮雕。 当试图找出船和失踪船员的下落时，他们意识到他们已经失去了与家的所有联系。 贝恩斯、沙利文、卡西迪和亨德里克斯与世界其他地方隔绝，也没有人来接他们，他们必须在相互怀疑的情况下进行斗争，并找到一条回家的新路。 如果家还在。