Lõbus komöödia kahest veidrast vennikesest, kellest üks on kurt ja teine pime. Kuid kahjuks said just need kaks meest mõrva tunnistajaks ja kuna üks nendest ei näe ja teine ei kuule, ei oska nad ka kedagi süüdistada ning politsei arvab, et see on nende kätetöö ja nad võetakse vahi alla. Kuid kui ühel hetkel avaneb neil hea võimalus vangist pääseda ehk põgeneda, kasutavad nad seda võimalust ära ning peagi hakkavad neile jahti pidama nii politsei kui mõrvarid ise.
Lõvi Alex, sebra Marty, kaelkirjak Melman ja jõehobu Gloria on ikka veel Madagaskaril, kuid vahepealse aja jooksul on sündinud sedavõrd hullumeelne plaan, et see võib isegi toimida. Nimelt on suutnud ettevõtlikud pingviinid seada töökorda vana lennukivraki ning nüüd kavatsevad sõbrad sellega tagasi koju lennata. Paraku püsib sõiduk õhus ainult natuke aega, millele järgneb hädamaandumine Aafrika südames. Seal kohtavad nad esmakordselt elus liigikaaslasi ning tutvuvad oma juurtega.