Black Book forteller historien om den unge kvinnen Rachel, som med nød og neppe overlevde nazistenes inntog i Holland, men måtte se sin familie bli drept. Fast bestemt på å komme morderne til livs, slutter hun seg til motstandsbevegelsen for å infiltrere det tyske hovedkvarteret i Holland. Med kvinnelist og sjarm lykkes det henne å komme helt inn på nazistenes toppledelse, og hun kan nå forberede det endelige oppgjøret med sin families bødler.
Dette er den sanne historien om den største falskmynteroperasjonen gjennom tidene, organisert av nazistene i 1936. Den jødiske falskmynteren Salomon "Sally" Sorowitsch blir sendt til konsentrasjonsleiren Sachsenhausen for å lede operasjonen. Den går ut på å lage utenlandsk valuta for å svekke økonomien til allierte motstandere, og Salomon får et moralsk dilemma.
Året er 1945, og en amerikaner med tyske gener ankommer etterkrigstidens Tyskland. Onkelen hans finner ham en jobb som konduktør på en jernbanelinje. Ønsket hans er å være nøytral og hjelpe dette landet som sliter med dårlig samvittighet og dype sår, men han opplever isteden å bli brukt både av de allierte og den innflytelsesrike tyske familien som eier jernbanelinjen. Da han forelsker seg i jernbanemagnatens datter skjønner han at han ikke kan være nøytral lenger, og at tiden er inne for noen vanskelige valg.
Når den britiske offiseren Harry Faversham går fra sin post like før regimentet hans skal sendes ut i krigen, får han tilsendt fire hvite fjær av sine tre nære venner og forloveden. De fire fjærene står for feighet, og fargen lyser av skam. For å bevise at han ikke er en feiging begir Harry seg ut på et hemmelig oppdrag. Forkledd, reiser han verden rundt med ett mål for øye; å gjenvinne vennenes respekt. I Sudan redder han livene deres, en etter en, og helteinnsatsen gir ham sjansen til å vinne tilbake sitt gode navn og rykte. Etter at vennene er overbevist, begynner han den lange reisen hjem til England. Der venter den vanskeligste oppgaven, å gjenvinne forlovedens kjærlighet. Filmen er basert på A.E.W. Masons roman fra 1902.