Året er 1954, den kalde krigen er på sitt kaldeste. U.S. Marshal Teddy Daniels og hans nye partner Chuck Aule blir sendt til Shutter Island for å etterforske en forsvinningssak. En briljant morderske innlagt på det strengt bevoktede Ashecliffe Hospital har på mystisk vis forsvunnet i løse luften. Daniels og Aule ankommer den avsidesliggende og forblåste øya, hvor de raskt omringes av granskende psykologer og livsfarlige psykiatriske pasienter. Den nifse og ustabile stemningen gir hint om at ikke alt er som det skal, men mens en orkan hamrer nådeløst ned over dem glir etterforskningen allikevel fremover. Alt er dog ikke som det virker ved første øyekast, og etter hvert som stormen øker blir mistankene og mysteriene stadig større og mer skremmende.

En erfaren journalist og en ung reporter prøver å avdekke sannheten rundt det mistenkelige dødsfallet til en kvinnelig bekjent av en mektig politiker.

Liam Case jobber som søppelkjører, men for å gjøre inntrykk på den søte bankassistenten nede i banken, iscenesetter han et bankran hvor han kan komme inn og avverge det hele, og dermed bli en ekte helt i hennes og i alle andres øyne. Men stuntet går galt. Liam blir skutt, og da han våkner opp på sykehuset sverger han hevn over sine forrædere. Han begynner en personlig vendetta mot den tøffe banden, men ikke alle er like begeistret for hans måte å skape rettferdighet på. Politimannen Terry Subcott mistenker Liam for en lang rekke selvtektsforbrytelser og er like i hælene på ham.