Em Guerra, César e os seus companheiros são forçados a entrar em confronto mortal com um exército de seres humanos liderados por um Coronel implacável. Depois de sofrer perdas inimagináveis, César luta com seus instintos mais obscuros e entra numa missão para vingar a sua espécie. À medida que a viagem chega ao fim, César e o Coronel confrontam-se numa batalha épica que determinará o destino das suas espécies e do futuro do planeta.

Baseado no livro epónimo de Boris Vasilyev, o filme é na Carélia (Noroeste da Rússia, perto da Finlândia) em 1941 durante a Segunda Guerra Mundial. Um belo e tranquilo deserto, longe da linha da frente, há um ponto de artilharia antiaérea, onde o cabo Vaskov está estacionado com um grupo de jovens mulheres em treino.