Gotham sa dostal do veľkého nebezpečenstva, keď vláda dala dohromady skupinu zločincov s názvom jednotka samovrahov a núti ich, aby sa vlámali do Akrhamského nápravného zariadenia, kde majú získať tajné informácie ukradnuté Riddler. Situácia naberie nečakané obrátky, keď jeden zo samovrahov oslobodí Jokera, ktorý má v pláne zničiť Arkham a Gotham. Batman bude musieť opäť použiť všetky svoje schopnosti, aby zastavil ako Jokera, tak samovrahov.
Tony Stark odmieta snahy vlády o vydanie svojej technológie pre potreby armády a tvrdí, že nepriatelia štátu sú vo vývoji o desaťročia pozadu. Na jeho veľké prekvapenie sa na pretekoch v Monze objaví podivný muž, Ivan Vanko, ktorý vo veľmi podobnom obleku napadne Starka. Vanka z väzenia unesie Tonyho konkurent Justin Hammer, ktorý chce, aby mu tajne vyrobil obleky Iron Mana. Vanko však sleduje len svoje záujmy a začne pracovať na vojnových robotoch. Čeliť nepriateľom pomáha Tonymu jeho verná Pepper a nová asistentka Natalie, ktorá je však v skutočnosti superhrdinka Čierna vdova.
Čerstvý absolvent Jaime Reyes sa vracia domov plný túžob po svojej budúcnosti, len aby zistil, že jeho domov už nie je taký, ako býval. Keď sa snaží nájsť si svoje miesto vo svete, Jaime sa nečakane ocitne vo vlastníctve prastarej pamiatky mimozemskej biotechnológie: Skarabea. Keď si Scarabeus náhle vyberie Jaimeho za svojho symbiotického hostiteľa, dostane neuveriteľné brnenie schopné mimoriadnych a nepredvídateľných síl, ktoré navždy zmení jeho osud a stane sa superhrdinom Blue Beetle.
Dej sa vracia k počiatkom Wolverinovej hrdinskej kariéry i tragickým udalostiam jeho života, z ktorých ho najviac poznamená smrť osudovej lásky Kayle Silverfox. Jej smrť spôsobí Wolverinovo zapletenie sa s tajným vládnym vojenským programom Weapon X. S projektom, ktorý mu navždy úplne zmení život. Pod velením Williama Strykera sa sformuje tajná vojenská jednotka Team X, zložená výlučne z mutantov. Jedným z nich je tiež Viktor Creed alias Sabretooth, neskrotná bytosť s neuveriteľnou silou, s ktorým musí Wolverine zviesť svoj najťažší súboj.