Ian Gray er en vitenskapsmann som forsker på det menneskelige øye og dets utvikling. Han er drevet av en sterk tro på videnskapen, men da han oppdager merkelige egenskaper ved sin egen sønns øyne, blir han rystet i sine grunnvoller og må ta sine teorier opp til ny vurdering.
Peter, Raymond og Egon pakker sammen protonene nok en gang i denne filmen - for å skremme vekk Manhattens onde ånd. Etter at de tre har lykkes med sin bekjempelse av byens slimete uhyrer, er de blitt arbeidsløse. Men - en gammel tyrann vender tilbake til jorden gjennom portrettet sitt på bymuseet. Han vil gjøre New York til verdens skumleste sted å leve. Det finnes bare et sted å søke hjelp: Ghostbusters...
Tank Girl (Rebecca) og vennene hennes er de eneste gjenlevende innbyggerne på den utarmede planeten som engang var Jorden. Alt det resterende vannet kontrolleres av Water og Power, storselskapet/myndighetene som styrer territoriet. Tank Girl og hennes nye venn Jet Girl sitter fengslet i W + P, men flykter og stjeler ... en tank og en jetmotor. Etter et møte med noen muterte kenguruer/mennesker, og etter at de har reddet en ung jente (adoptert av vennene hennes), tar kenguruene og jentene rotta på Water og Power.