Az Impossible Mission Force-t feloszlatták, Ethan így magára hagyott ügynök lett, és a csapat ebben a helyzetben kerül szembe egy magasan képzett különleges ügynökökből álló hálózattal, a Szindikátussal. A rendkívül rátermett alakulat minden áron új világrendet akar létrehozni, és ezt terrortámadások egyre durvuló sorozatával szándékozik véghez vinni. Ethan összegyűjti csapatát, és hozzájuk szegődik a szakadár brit ügynök, Ilsa Faust is, aki talán a tagja ennek az "titkos nemzetnek". Így néznek szembe az eddigi leglehetetlenebb küldetésükkel.

Joe Merriweather és társa, Katherine Cowles egy új, rejtélyes, gyilkosságait tökéletesen megkomponáló sorozatgyilkos után nyomoz. Látszólag semmiféle összefüggés nincs a kiválasztott személyek között, csupán a módszer és a gyilkos eszköz egyezik, de a tettes egyetlenegy alkalommal sem vétett hibát, nem hagyott DNS-mintát sehol, és rébuszos leveleit sem tudják értelmezni. Joe-nak van egy ismerőse, aki talán segítségükre lehet, mert már nem először szállt be az FBI nyomozásába, hogy különleges képességével segítse kézre keríteni a gyilkosokat. John Clancy visszavonultan él, mióta lányát elvesztette leukémiában. Feleségével a tragédia után különváltak, nem igazán mozdul ki, de ez az új eset felkelti az érdeklődését, és elfogadja régi barátja kérését, hogy megérzéseivel próbálja megfejteni a bűntetteket.

Milyen hősre van szüksége a világnak? Gotham City védelmezője úgy érzi, hogy Metropolis megmentője már istenként tekint magára, senki és semmi nem korlátozza, így szembefordul vele. De a világ nem törődik velük, mert más kérdésekre keresi a választ: senki nem tudja, mit szeretne: mindenható védelmezőt, vagy függetlenséget. Amíg Batman és Superman az egymás ellen folytatott háborújukkal vannak elfoglalva, egy új, minden eddiginél rémisztőbb fenyegetés egyre erősebbé válik. Az emberiség még sosem volt ekkora bajban - és talán már nincs, aki segíteni tud rajta.