Rok 1984. Do pádu režimu v NDR zostáva necelých šesť rokov. Vládnuca Jednotná socialistická strana upevňuje svoju pozíciu pomocou nemilosrdného systému monitorovania a manipulácie s potenciálne nebezpečnými ľuďmi, k čomu využíva tajnú políciu Stasi. Verný stúpenec režimu, kapitán Gerd Wiesler, je ministrom kultúry poverený zhromažďovaním kompromitujúcich dôkazov proti známemu divadelnému dramatikovi Georgi Dreymanovi a jeho atraktívnej priateľke, herečke Christe-Marii Sieland. Dôvod je ale prozaický - minister sa do krásnej herečky zamiloval. Akonáhle sa však Wiesler do sveta dvoch divadelných hviezd ponorí, začne byť ich životmi fascinovaný a uvedomí si obmedzenosť svojej vlastnej existencie. Preto začína tejto dvojici pomáhať a kryje ich protištátnu činnosť. Weislerov šéf ale Christu napriek všetkému zatýka a donúti ju k spolupráci a donášaniu na jej partnera. Pád Berlínskeho múru sa ale blíži ...
V druhom pokračovaní trilógie Matrix Neo (Keanu Reeves) spoločne s Morphom (Laurence Fishburne) a Trinity (Carrie-Anne Moss) bojujú proti počítačovým vládcom univerza. Chcú zastaviť zotročenie ľudstva a nemajú inú možnosť ako boj na život a na smrť. Sú nútení preniknúť hlboko do štruktúr Matrixu a v priebehu sedemdesiatich dvoch hodín objaviť a zlikvidovať centrum Zion i s jeho pomocnými jednotkami. A aby toho nebolo málo, Neo sa zo svojich temných nočných mor dozvie, že Trinitiným osudom je smrť. Neo sa však proti osudu už raz dokázal vzbúriť. Medzitým sa Trinity a Morpheus snažia zachrániť Kľúčiara, ktorý dokáže otvoriť každé dvere v Matrixe a je dôležitou zbraňou ľudí v boji proti strojom. I medzi robotmi prebieha súperenie o nadvládu nad virtuálnou realitou. Zároveň sa snažia objaviť posledné ľudské mesto Zion, ukryté v hlbinách Zeme. Všetky udalosti neodvratne smerujú k veľkej vojne ľudí proti strojom.
V záverečnej časti trilógie vedie armáda Zionov, podporovaná odvážnymi civilnými dobrovoľníkmi, neúprosný boj, aby odvrátila inváziu Sentinelu. Zostávajúce ľudské pokolenie bojuje nielen o holé životy, ale o budúcnosť ľudstva samotného. Neznámy prvok otrávi mužstvo a ničivého plánu Smitha sa okamžite zmocní Bane, člen konvoja. Každým ďalším okamihom sila rastie. Smith je za hranicou kontroly robotov a teraz hrozí zničenie ich ríše, reálneho sveta Matrixu.
V monštruóznom podzemnom labyrinte žijú uniformovaní obyvatelia, ktorým ich holohlavé lebky dodávajú odľudštenú vizáž. Ich životy sa riadia presným stereotypom a príkazmi "zhora", celé ich životné snaženie je nasmerované výlučne na zvyšovanie produktivity. Hlavný hrdina je jedným z mnohých nádenníkov v tomto ohromnom ľudskom mravenisku a i jeho osobnosť - rovnako ako osobnosť jeho kolegov - je symbolicky zredukovaná do znakov jeho mena - THX 1138. V tomto svete bez individuálnych ľudských životov, emócií a vášní nie je priestor pre nepredvídané a nevypočítateľné. Preto sú všetci obyvatelia povinní užívať denné dávky sedatív, utlmujúcich akékoľvek spontánne ľudské prejavy. Za ich nepovolené vysadenie hrozí prísny trest.
Z väzenia v Írsku ujde psychopat Ryan Gaerity. Dostane sa do USA, kde sa chce pomstiť Liamom McGinleymu, ktorý bol pred dvadsiatimi rokmi jedným z členov jeho teroristickej skupiny, ale teraz žije pod menom Jimmy Dove v Bostone a pokúša odčiniť svoju vinu prácou u policajného pyrotechnického oddielu. Práve sa rozhodol požiadať o ruku svoju milenku Kate, ktorú miluje, rovnako ako jej dcérku Lizzy, a súčasne odísť z aktívnej služby do funkcie inštruktora, keď Ryan prvýkrát udrie...