I dette japanske dramaet, satt på 1700-tallet, kjemper samurai krigere hverandre i deres søken etter en mester i kjølvannet av en Shogun-mandert desentralisering. Et potensielt offer er tvunget til å utføre ritualet med et treblad. Familien hans forsøker å dekke opp hans degraderende dødsfall.

Snake Eyes tas i mot i den japanske klanen Arashikage etter å ha reddet arvingen deres Storm Shadow, og slutter seg nå til kampen mot terroristgruppen Cobra. Under maksimalt press vil Snake Eyes utvikle seg til den ultimate krigeren.

Skilpaddene hadde en erkefiende i mange år, Shredder, som de til slutt klarte å beseire. I tiden etterpå har skilpaddene vokst litt fra hverandre som familie, og deres læremester, rotten Splinter, strever med å holde dem samlet. Splinter blir bekymret når merkelige ting begynner å skje i New York, og trenger å få skilpaddene til å stå samlet for å kunne hamle opp med det som venter.

Tre utvalgte, guidet av guden Raiden, må delta i den 10. MORTAL KOMBAT konkurransen. De andre deltakerne består av merkelige og mektige fiender - inkludert den forferdelige, firearmede prinsen av Shokan, Goro. Han har vunnet de ni foregående konkurransene, og jorden går en forferdelig tragisk evighet i møte hvis han vinner igjen Sterke krefter kjemper om makt og kontroll. De tre utvalgte må bruke all sin kløkt og all sin styrke for å redde menneskeheten og de gode krefter i universet.

En ny æra ... men for hvem? Det var forventet at Mortal Kombats seier i Outworld ville være startskuddet for en fredfull generasjon på Jorden. Men du kan aldri stole på de maktgale! Jorden står for fall om ikke en gruppe modige helter ikke kan tilegne seg de nødvendige kampsportkunnskapene for å knuse Outworlds fantasifulle gjeng av råe krigervesener.