Divné veci sa dejú stále. Niekedy za to možno môže súhra životných náhod, inokedy ľudia, ktorí robia omyly, páchajú hriechy, konajú zlé aj dobré skutky. Alebo sú za všetkým "nebesá" hroziace apokalypsou a dávajúce pritom novú nádej a snáď aj možnosť začať znova. O tom všetkom rozpráva film Magnolia prostredníctvom deviatich príbehov, ktoré sa navzájom prelínajú vo farbistej mozaike prepojené televíznou vedomostnou šou. Všetky príbehy sa odohrávajú v jednom meste počas jedného dňa. Miestom deja sa stala ulica Magnolia vedúca východozápadne cez losangeleskú predmestskú časť San Fernando Valle.

Príbeh začína v roku 1989, kedy nadšene-socialistická pani Kernerová upadne do kómy, keď uvidí v televízii svojho syna, ako sa zúčastňuje protištátnej demonštrácie. V kóme pretrvá celých 8 mesiacov a prespí tak pád Berlínskeho múru, zjednotenie Nemecka i konečné víťazstvo kapitalizmu. Po jej precitnutí je potom na jej synovi Alexovi, aby podľa odporúčania lekárov zabránil šoku, ktorý by ju mohol zabiť. Alex začne v panelákovom byte s rozlohou 79 metrov rozohrávať veľkolepú mystifikáciu. Pani Kernerová pripútaná na domáce lôžko si tak ďalej užíva socializmus a televízne správy s bozkávajúcimi sa súdruhmi. Netuší, že si synáčik zariadil svoje malé televízne štúdio a pripravuje so svojimi kamarátmi dobové správy...