Academy Award-vinner Matt Damon er på flukt igjen som Jason Bourne, den tidligere CIA-trenede og perfekte leiemorderen, i denne intelligente og spennende actionthrilleren. Bourne, som lider av hukommelsestap, har lagt sin voldelige fortid bak seg og lever et normalt liv sammen med kjæresten Marie. Men planene hans for et fredfylt liv faller i grus når han så vidt slipper unna et drapsforøk. En ukjent fiende er nå op jakt etter Bourne, som beviser at han verken er et lett mål eller en person hvis evner, besluttsomhet og seiglivethet ikke må undervurderes. "The Bourne Supremacy" er en sterk og gripende film med nervepirrende biljakter, og er en av de mest intelligente, spennende og actionspekkede thrillers de siste årene.
Drosjesjåføren Max plukker opp en mann som tilbyr ham 600 dollar for å kjøre ham rundt. Men tilbudet om lettjente penger blir etterhvert til et mareritt når Max innser at passasjeren hans er en leiemorder.
Det monderne samfunnet skiller mellom rett og galt, godt og vondt, sinne og anger. Et øyebikks selvopptatthet og sinne vil få to menn til å gå over streken. Etter hvert som viljekampen trapper opp, forandres livene deres for alltid. Begge er på randen av selvutslettelse og det eneste som føles viktig er å frarøve den andre noe verdifullt for på den måten å kreve kompensasjon for det han selv har mistet.
David's kone Mary blir funnet død, og han selv er øverst på politiets liste over mistenkte. Imidlertid kommer saken aldri opp for retten, siden detektivene som etterforsket saken gjorde en brøler - som førte til at saken ble avvist. Imidlertid forandrer dette ikke folks mening om saken; i offentlighetens øyne er David så godt som skyldig. Når han kommer i kontakt med forskeren Dr. Martha Briggs, aner David håp. Hun han nemlig utviklet et serum som gjør det mulig å gjenskape andre folks minner via ryggmarksvæske. David knekker til oppgaven, men glemmer at serumet fremdeles er uprøvet på mennesker og kan gi skumle bivirkninger!