أثناء عودتها إلى الأرض ، تعترض سفينة الفضاء التجارية نوسترومو إشارة استغاثة من كوكب بعيد. عندما يكتشف فريق مكون من ثلاثة أفراد من الطاقم غرفة تحتوي على آلاف البيضات على الكوكب ، يهاجم كائن داخل إحدى البيوض مستكشفًا. الطاقم بأكمله غير مدرك للكابوس الوشيك الذي سيحل عليهم عندما يولد الطفيلي الغريب المزروع داخل مضيفه المؤسف.
تدور أحداث الفيلم حول مجموعة من جنود الفرقة الخاصه، يقودهم الكابتن (داتش شافير) يتم إرسال المجموعة لإنقاذ (جورج ديلون) الدبلوماسي الأمريكي، الذي سقطت طائرته في إحدى غابات أمريكا الجنوبية. ولكنهم يفاجؤوا بوجود شيء ما يقتل أفراد الفريق واحدًا تلو الآخر، وهذا الشيء هو مخلوق فضائي يستطيع التكيف مع أشجار الغابة، ويمكن أن يقوم بإخفاء نفسه وهو يمتلك تقنية دفاعية وهجومية عالية ومتطورة.
راي فيرير هو عامل رصيف مطلق وأب أقل من الكمال. بعد فترة وجيزة من توصيل زوجته السابقة وزوجها الجديد ابنه المراهق وابنته الصغيرة في زيارة نادرة في نهاية الأسبوع ، هبت عاصفة رعدية قوية وغريبة.
مركبة فضائية عملاقة قوتها هائلة تُدمِّر ثلاث طوافات كالينجنية قوية داخل مجال الاتحاد. بعدها يؤمَر الأدميرال (جيمس ت. كيرك بقيادة مشروع (USS) للمرة الاولى منذ مهمتها التاريخية التي استمرت لخمس سنوات.
سام ويتويكي يترك الأوتوبوت وراءه ليحيا حياة طبيعية. ولكن عندما يمتلئ عقله بالرموز المبهمة ، يستهدفه الديسيبتيكون ويتم جره مرة أخرى إلى حرب المحولات.
تدور أحداث الفيلم في مطلع القرن الحادي والعشرين ،حول مجموعة من علماء الآثار والمهندسين الذين يتوجهون تحت قيادة رجل الأعمال تشارلز ويلاند (لانس هنريكسون) إلى قارة أنتارتيكا في بعثةٍ علمية ،بغرض الكشف عن هرمٍ قديمٍ مدفون تحت الجليد، يعُتقد بأنه موجود من قبل بناء الأهرامات المصرية وأهرامات الآزتيك، وهناك يجدون أنفسهم في خضم معركة شرسة حتى الموت تدور بين كلٍ من الكائنات الفضائية والمفترسين.
للعثور على الحقيقة ، يجب أن تؤمن. بعد ست سنوات من أحداث خاتمة سلسلة ملفات X ، أصبحت عميلة مكتب التحقيقات الفيدرالي السابقة الدكتورة دانا سكالي الآن طبيبة في مستشفى سيدة الأحزان ، وهو مستشفى كاثوليكي ، وتعالج صبيا يدعى كريستيان مصابا بمرض ساندهوف ، وهو حالة دماغية نهائية. يصل عميل مكتب التحقيقات الفيدرالي طبل لطلب مساعدة سكالي في تحديد مكان فوكس مولدر، الرئيس السابق الهارب لقسم ملفات X ، ويقول إنهم سيلغون مطاردته إذا كان سيساعد في التحقيق في اختفاء العديد من النساء ، بما في ذلك عميلة مكتب التحقيقات الفيدرالي الشابة مونيكا بانان. يتم استدعاء مولدر وسكالي مرة أخرى إلى الخدمة من قبل مكتب التحقيقات الفيدرالي عندما يدعي كاهن سابق أنه يتلقى رؤى نفسية تتعلق بعميل مختطف.