Историята се развива по времето на Наполеон. Сюжетът ни запознава със съдбата на капитан Джак Обри и близкия му приятел д-р Стивън Матюрин. В началото на филма корабът "Изненада", чийто капитан е Обри, претърпява сериозни щети от значително по-голям от него френски кораб. Хората му са ранени. На Обри не му остава друго, освен да избяга, за да спаси кораба си и след това да го ремонтира, преди да нападне противника си.
Елитен екип от "тюлени", воден от лейтенант А.К.Уотърс, е изпратен дълбоко в нигерийската джунгла, за да открие и спаси д-р Лена Кендрикс. Д-р Кендрикс, американска гражданка по съпруг, се грижи за жертвите на продължаващата гражданска война в католическата мисия на изоставено село. С пристигането на Уотърс, д-р Кендрикс отказва да напусне селото, докато той не й обещае, че ще се погрижи да осигури политическо убежище на 70 бежанци отвъд близката граница. В противен случай те трябва да разчитат на милостта на бунтовническата армия. Това напълно променя характера на мисията.
Действието във филма се развива на Филипините през 1945 г. и разказва истинската история на 6-ти батальон, който под командването на лейтенант-полковник Хенри Муци (Бенджамин Брат) се заема с рискована спасителна мисия. Навлизайки 30 мили навътре зад вражеската линия, 6-ти батальон цели да освободи над 500 американски военнопленници от прочутия японски лагер Кабанатуан в най-дръзката възможна мисия.
Да се издигнат високо над земята в крехък, лесно запалим биплан с открита кабина, да надделяват над по-добре екипирания самолет на противника и да знаят, че средната продължителност на живота в тяхната професия е от 3 до 6 седмици - такава е дръзката и героична задача на мъжете от ескадрилата "Лафайет", първата американска ескадра от бойни пилоти, включили се доброволно в Първата световна война.
„Железен орел 2“ е филм в жанр екшън, който разказва за съвместна съветско-американска акция с цел унищожаване на мишена в неназована държава от Близкия изток. Екипът е ръководен от полковника от Американските военновъздушни сили Чарлз „Чапи“ Синклер (Луис Госет младши). Държавата в Близкия изток е под прицела на ядрени междуконтинентални балистични ракети, изпращани орт двете суперсили. В същотпо време в екипа настъпват спорове, породени от политическото съперничество и културните различия на двете страни. Пилотът от Американските военновъздушни сили капитан Мат „Куп“ Купър (Марк Хъмфри), бивш другар на Дъг Мастърс (Джейсън Гедрик), е важна част от екипа като командир на полетите. Филмът печели 10 497 324 долара. „Железен орел 2“ е сниман в Израел. Снимачните площадки са близо до база на Израелските военновъздушни сили близо до Хайфа, в пустините, планините и по брега на Мъртво море. Пилоти от Израелските военновъздушни сили изпълняват въздушните маневри във филма.