Ikari Shinji egy átlagos, 14 éves fiúnak mondhatta magát egészen addig, amíg meghívást nem kapott, hogy utazzon el a Tokyo 3-ban lévő NERV központba. Meg is tette a hosszú távot, hogy újra láthassa édesapját, aki annak a központnak a parancsnoka. De megérkezése nem zajlik zökkenőmentesen. Megpillant egy hatalmas lényt, melyet Angyalnak hívnak. Itt találkozik Misatóval, egy csinos hölggyel, aki elviszi őt a központba. Mint utóbb kiderül, az apja csak azért hívatta, hogy egy óriásrobotot vezessen, melyet Evangelion-nak hívnak. Mint később kiderül, még egy Eva létezik. Ezek a szerkezetek az egyetlenek, amik felvehetik az Angyalok ellen a harcot. Irányítani csak 14 éves gyerekek tudják, mert csak ők tudnak összehangolódni az Eva-kkal. Shinji eleinte nem akarja elvállalni, de amint meglátja, hogy apja képes egy sérült lányt a neki szánt Evangelion-ba ültetni, meggondolja magát és kezébe veszi a sorsát.
Öt ember teljesen átlagos módon kezdi a munkanapját Philadelphiában. Beszállnak egy irodaház liftjébe. Teljesen ismeretlenek egymás számára. Csak pár másodpercet szándékoznak a többiek társaságában tölteni, ám a fülke hirtelen elakad. A sors közbeszólt. Feltárulnak a féltve őrzött titkok, és mindenkinek felelnie kell bűneiért.A kezdetben csupán kényelmetlen helyzet lassan, de biztosan egyre rémületesebbé válik. Szörnyű dolgok történnek mindegyikükkel, és egyre valószínűbb, hogy az eseményeket közülük valaki irányítja. Végül kiderül az elképesztő igazság: egyikük maga az Ördög. Miközben kívülről hasztalan próbálják kiszabadítani őket, a lift utasai rájönnek, csak akkor élhetik túl ezt a napot, ha szembeszállnak a gonosszal.