O ano é 2034. Passaram-se dois anos desde que Motoko Kusanagi deixou a Secção 9. Togusa é agora o novo líder da equipa, que aumentou consideravelmente o seu pessoal nomeado. A nova Secção 9 confronta uma onda de incidentes complicados, e as investigações revelam que um hacker ultra sofisticado está por detrás de toda a série de eventos.

A rebeldia de hackers que foram de encontro ao modelo proprietário de desenvolvimento de software e criaram softwares livres com a filosofia de Richard Stallman e a Free Software Foundation. O filme aborda a história do sistema GNU/Linux - que há muito tempo vem tirando o sono da gigante Microsoft.Filmado no Vale do Silício, narra o nascimento e o crescimento do GNU/Linux e como o sistema operacional com código de fonte aberto teria virado uma ameaça ao "modo de vida Microsoft".Durante os 85 minutos de filme, há entrevistas com o finlandês Linus Torvalds, criador do kernel Linux, Richard Stallman, fundador do projeto GNU e da Free Software Foundation, organização que luta pela popularização de softwares livres, e outras pessoas envolvidas no processo de concepção do movimento do software livre e do Open Source.

Lynn é assassina profissional e sua irmã, Sue, fica em casa dando cobertura nas missões. O policial Hong as persegue após terem matado um importante empresário, mas os três terão que trabalhar juntos quando um inimigo em comum quer acabar com eles.

Uma empresa de petróleo contrata os serviços de detetive particular Varg Veum para localizar Arne Smuelsen um funcionário desaparecido. Varg descobre o corpo decapitado de uma mulher na geladeira do apartamento de Arne e alguém bate em sua cabeça deixando-o inconsciente. Quando acorda, a polícia está no apartamento e o corpo da mulher desapareceu sem deixar vestígios. Varg deve limpar seu nome e enfrentar um mafioso cruel num labirinto de perigo, trapaças e ambiguidade sexual.