الفيلم يتحدث عن ذكريات العجوز كارل فريدريكسون (كرم فَريد زين في النسخة العربية) البالغ 87 عاماً الذي حلم طيلة حياته هو وزوجته أن يزورا حدائق وغابات أمريكا الجنوبية، إلا أنها توفيت قبل أن يحقق لها ما تريد، فيقرر الذهاب إلى هناك مباشرة. ولأنه كان بائعا للبالون يقرر السفر إلى هناك مع منزله الذي يحمل معه كل ذكرياته، بأن يرفع البيت بعدد كبير من البالون المليء بالهيليوم ويبحر به كالمنطاد. ومع انطلاقه فوق لا يلاحظ العجوز أن أحد الأطفال الفضوليين قد تعلق بشرفة المنزل وارتفع معه. وهنا تبدأ المغامرة حيث رجل عجوز وطفل شقي في مغامرة بغابات وأدغال فنزويلا.

إن مطاردة وكالة المخابرات المركزية هي العقل المدبر لموجة من الهجمات الإرهابية. روجر فيريس هو رجل الوكالة الموجود على الأرض ، ويتنقل من مكان إلى آخر ، ويسارع للبقاء في مقدمة الأحداث المتغيرة باستمرار. عين في السماء - وصلة فضائية - تراقب فيريس. في الطرف الآخر من هذا الرابط في الوقت الفعلي ، يوجد إد هوفمان من وكالة المخابرات المركزية ، والذي يضع إستراتيجيات للأحداث من على بعد آلاف الأميال. وبينما يقترب فيريس من الهدف ، يكتشف أن الثقة يمكن أن تكون خطيرة بقدر ما هي ضرورية للبقاء.

إستكمالاً لأحداث الجزء الأول، تحاول الحيوانات العودة إلى موطنها في نيويورك، ومنهم الأسد (أليكس) بعد أن تخلى عن طبيعته المفترسة، لكن تسقط الطائرة التي صنعها البطاريق في إحدى المحميات في أفريقيا، يلتقي فيها الأسد (أليكس) بعائلته، ويحاول إثبات نسبه الملكي بالصراع مع (مكونجا)، في الوقت ذاته تكون الزرافة (ميلما) هي الطبيب الساحر الجديد، في الوقت الذي تحاول فيه البطاريق صنع طائرة جديدة للعودة إلى نيويورك.