Thomas A. Anderson čovjek je koji živi dva života. Po danu je običan kompjuterski programer, a po noći haker po imenu Neo. Neo je uvijek ispitivao stvarnost, no istina je daleko od onog što je zamišljao. Kada se nađe na meti policije, kontaktira ga Morpheus, legendarni haker kojeg vlada smatra teroristom. Morpheus pokaže Neu pravi svijet, pustoš u kojem je većina ljudi zarobljena od strane strojeva koji žive od ljudske tjelesne topline i energije, a njihove mozgove zarobljuju u umjetnoj stvarnosti nazvanoj „The Matrix“. Kao pobunjenik protiv strojeva, Neo se mora vratiti u Matrix i suočiti sa agentima – super-moćnim kompjutorskim programima kojima je jedina misija riješiti se ljuskih pobunjenika.
Astronaut David Bowmann (K. Dullea) pozvan je u glavni stožer svemirskih istraživanja da preuzme, zajedno sa svojom skupinom, nov i vrlo neobičan zadatak. Zapovijed je dokučiti tajanstvenu, misterioznu funkciju geometrijski pravilnog crnog monolita iz Mjesečeva kratera. Kontrola leta povjerena je najnovijem modelu računala - HAL-u 9000. No, računalo zakazuje i David ostaje u svemiru doživjevši potpunu preobrazbu.
Tvrtka Tyrell koja proizvodi replikante suočena je s problemom. Roboti koji se ni u čemu ne razlikuju od ljudi, "samo" nemaju emocija, pobunili su se i njih nekoliko se vraća na Zemlju. Tamo ih čekaju posebni policajci, "istrebljivači" osposobljeni za njihovu likvidaciju. Tvrtka je čak iz mirovine pozvala u pomoć najboljeg od njih, Deckarda.
Zbliživši se s Trinity, Neo je u njoj pronašao ženu svog života, ali ga muče tjeskobni snovi o djevojčinoj pogibiji. Istodobno, neuništivi agent Smith, udarna snaga Matrice kreirana za uklanjanje mogućih pogrešaka sustava, postaje sve moćniji i stječe sposobnost umnogostručivanja. Zionom, posljednjim uporištem ljudskog otpora strojevima smještenom duboko pod površinom Zemlje, vlada vijeće kancelara među kojima u Nea najviše vjeruje iskusni Hamann. Prilikom još jednog razgovora s Oracle, tijekom kojeg posumnja da je i ona dio Matrice, Neo dozna da što prije mora pronaći Ključara, čovjeka uz čiju pomoć bi mogao doprijeti do samog Arhitekta, stvoritelja Matrice. No da bi pronašao Ključara, Neo se mora susresti s podlim Merovingianom, šefom podzemlja i ljubavnikom lijepe Persephone...
U budućnosti u kojoj znanstveni napredak omogućuje postojanje, ljudi će sve aspekte svog života povjeriti sofisticiranim robotima koji se nazivaju Meccas. Emocija je posljednja granica u evoluciji strojeva. Ali kada se napredno robotsko dijete po imenu David programira na ljubav, ljudi nisu spremni za posljedice.
Na trinaestom katu nebodera vizionari Douglas Hall (Craig Bierko) i Hannon Fuller (Armin Mueller-Stahl) najnovijom virtualnom tehnologijom na kompjuterskom su čipu stvorili Los Angeles, godine 1937. Fuller otkriva nešto iznimno važno, ali kada primijeti da je u opasnosti, u paralelnom svijetu ostavlja pismo Hallu. Kada se Hall probudi, ne sjećajući se prošle noći, pronalazi krvavu odjeću u svojoj kupaoni, Fullera izbodenog nožem, a on sam glavni je osumnjičeni. Kako bi riješio zločin, Hall započinje potragu za istinom koja ga odvuče u svijet prijevara i ubojstava. Stvarnost i fantazija nastavljaju se ispreplitati, a tanka linija koja ih razdvaja postaje još nejasnija kada Hall upozna prelijepu i zagonetnu Jane (Gretchen Mol). Kako bi pronašao odgovore, Hall mora prijeći granicu stvarnog u kompjuterski simulirani svijet koji je stvorio.
U 2035. godini roboti su uređaji kojima se svakodnevno koristimo i kojima vjerujemo, osim jednom paranoičnom detektivu (Smith), koji istražuje ono za što sam vjeruje da je zločin počinjen od strane robota. Slučaj ga tjera da otkrije nešto još gore što prijeti ljudskom rodu. Will Smith će glumiti u ovom akcijskom trileru nadahnut klasičnom zbirkom kratkih priča Isaaca Asimova, a u film ga je napravio dinamični i vizionarski redatelj Alex Proyas (Dark City, The Raven). U ovom su filmu korištene najmodernije i najspektakularnije tehnike vizualnih efekata za oživljavanje svijeta robota.
Spašavajući smrtno ranjenu Trinity i boreći se protiv agenta Smitha, okretni Neo, Odabrani kojem je proročica Oracle predvidjela ključnu ulogu u oslobađanju ljudi od vlasti parazitskih strojeva, i sam je teško ranjen pao u komu. Dok on na virtualnoj postaji podzemne željeznice mora odabrati između života i smrti, u čemu bi mu mogli pomoći inženjer Rama-Kandra, otac djevojčice Sati, i zagonetni Skretničar, Morpheus, Trinity i Dječak suprotstavljaju se zlom Merovingianu. Kad se vrati među žive, Neo shvati da se mora vratiti izvoru i spoznati sama sebe, jer agent Smith svakim trenutkom postaje sve snažniji i opasniji. O ishodu njihova sukoba ovisi budućnost čovječanstva i pobjeda nad Matricom. U međuvremenu, strojevi se približavaju Zionu, a u obrani kolonije sudjeluje i odvažna Zee, supruga Neova suborca Linka. Istodobno, izdajnik Bane ubojstvom liječnice pokaže svoje pravo lice...
Svemirski brod Enterprise prolazi zadnju fazu priprema prije nego što krene u presretanje tajanstvenog oblaka koji se velikom brzinom približava Zemlji. Kapetan James T. Kirk (William Shatner) stiže na brod i preuzima komandu od kapetana Willarda Deckera (Stephen Collins), koji je time vrlo razočaran ali ipak prihvaća mjesto prvog časnika. Na brod stiže i Deltanka Ilia (Persis Khambatt) koju s Deckerom povezuje romantična prošlost. U međuvremenu im se pridružuje i Spock (Leonard Nimoy), koji nije uspio proći obred Kolinahr te se vraća na Enterprise. Prva nevolja na koju nailaze je velika crvotočina koja ih zamalo uništava. Uskoro stižu do oblaka, ali otkriju da je oblak živo biće po imenu V'ger koje skriva tajnu staru 3 stoljeća...