Steve Rogers est désormais à la tête des Avengers, dont la mission est de protéger l’humanité. À la suite d’une de leurs interventions qui a causé d’importants dégâts collatéraux, le gouvernement décide de mettre en place un organisme de commandement et de supervision. Cette nouvelle donne provoque une scission au sein de l’équipe : Steve Rogers reste attaché à sa liberté de s’engager sans ingérence gouvernementale, tandis que d’autres se rangent derrière Tony Stark, qui contre toute attente, décide de se soumettre au gouvernement…

Dans un quartier malfamé, alors qu'il se rend à une laverie pour faire sa lessive, Frank Castle est témoin d'un impitoyable gang de rue qui harcèle plusieurs personnes.

Les événements du film se déroulent après l'action de Bilbo le Hobbit et avant celle de la Communauté de l’anneau si l'on considère les adaptations cinématographiques de l'univers de Tolkien1. Gandalf, craignant que Gollum ne révèle des informations concernant l’Anneau unique à Sauron, envoie Aragorn à sa recherche.

Une ancienne prophétie mène le puissant maître Jedi Sorran à se mettre en quête d'Eron, un endroit légendaire capable de donner la connaissance absolue à celui qui ouvrira son sceau. A cause de son obsession, beaucoup d'apprentis meurent. Sorran est répudié et apparemment tué par les dirigeants de son propre conseil.

Santo et Butter Naples font équipe pour mettre fin à la malédiction de La Llorona en mettant la main sur un médaillon spécial. Malheureusement, La Llorona s'échappe dans le processus.