Thomas Anderson é um jovem programador que, fora das horas de serviço, dá pelo nome de Neo, um «hacker». Ele sempre percebeu que algo no mundo não estava bem. A esperança de encontrar as respostas que procura leva-o a seguir o «coelho branco». E depois, a vida dele nunca mais será a mesma.
Após um incidente em que é impedido de andar numa montanha-russa por ser ainda novo, o jovem Josh, num momento de revolta, pede a uma máquina Zoltar (que imita um adivinho ou mago) para ser grande. No dia seguinte, para sua surpresa, o pedido foi de facto realizado e tem de fugir de casa após a mãe não o reconhecer e tomar por um intruso mal-intencionado. Josh, porém, continua a ser só uma criança, agora perdida no mundo complicado dos adultos, onde precisará de se ir adaptando.
Allegra Geller, uma líder mundial na criação de jogos, está a testar o seu novo jogo de realidade virtual, “eXistenZ”, com um grupo específico. Quando o teste é iniciado, ela é atacada por um assassino fanático que utiliza uma arma biológica bizarra. Ela foge com um jovem estagiário de marketing, Ted Pikul, que,repentinamente, é designado para ser seu guarda-costas. Infelizmente, o seu “pod”, um dispositivo orgânico de jogos, que contém a única cópia do programa do jogo “eXistenZ”, está danificado. Para inspecioná-lo, ela convence Ted a aceitar um portal de jogos no seu próprio corpo para que ele possa jogar o jogo com ela.
Novo, bonito e rico, dono de um grande grupo editorial, David Aames, pode ter tudo quanto desejar. No entanto, a sua vida de luxúria parece incompleta. Uma noite, David conheçe a mulher dos seus sonhos e acredita ter encontrado tudo o que lhe faltava. Mas um fatal encontro com a ciumenta amante, vira inesperadamente o seu mundo de pernas para o ar, atirando-o para uma vertiginosa viagem de romance, sexo, suspeição e sonhos.
Três amigos estão em uma viagem pelo sudoeste americano à procura de um gênio da computação, que conseguiu invadir os computadores do MIT e expôr uma série de falhas de segurança. Eles acabam indo parar em uma área isolada, onde, de repente, tudo fica escuro. Quando Nic (Brenton Thwaites) enfim desperta, logo percebe que está em meio a um pesadelo.