Takumi a quitté le Japon malgré la désapprobation de son père. Après une longue absence, il rentre à Toyama, sa ville natale, petit port en déclin de la côte nord du Japon.

Le Nécrophile raconte les aventures d'un homme monstrueux, nécrophile et nécrophage, contraint d'adopter sa nièce après le décès de ses parents.