Um executivo de música sem escrúpulos e seu lacaio sequestram uma banda techno alienígena de pele azul, roubam suas identidades, fazem-nos passar por humanos e os impõem a um público desavisado na Terra. Após sua chegada e seu impacto na população humana, os membros da banda tentam recuperar suas identidades, escapar das garras do executivo da música maligna e retornar ao seu próprio mundo. O filme é a realização visual de "Discovery", um álbum dos Daft Punk. Cada clipe do álbum foi animado como um episódio da história de sequestro e resgate de uma banda de pop interestelar. Uma continuação da história contada nos videoclipes dos Daft Punk "One More Time", "Aerodynamic", "Digital Love" e "Harder, Better, Faster, Stronger".
Um egiptólogo pouco ortodoxo e sem reconhecimento académico é convidado pelos militares norte-americanos a trabalhar numa base secreta onde se guarda um anel de pedra coberto de hieróglifos, descoberto décadas antes no Egipto, e que muito intrigava os especialistas. Descobre então que ele é um portal que pode ser aberto para se chegar a outro mundo. Juntamente com uma pequena força de elite do Exército, ele atravessa-o rumo a outro mundo, onde os humanos são escravizados pelos seus deuses.
O ano é 2020, e a primeira missão tripulada para Marte, comandada por Luke Graham, pousa no planeta vermelho. Mas o cenário de Marte abriga um estranho e terrível segredo que provoca um misterioso desastre, tão catastrófico que pode ter exterminado a tripulação. Alertada pela última e ambígua mensagem de Graham, a NASA lança uma Missão de Salvamento para Marte, a fim de investigar e, se possível, resgatar sobreviventes.
Chris Kelvin (George Clooney) é um psicólogo que ainda sofre a perda de seu grande amor, Rheya (Natascha McElhone), alimentando um sentimento de culpa pelo ocorrido. Kelvin é convocado para investigar o estranho comportamento dos integrantes de uma estação espacial que orbita o misterioso planeta Solaris, que perdeu contato com a Terra. Inicialmente relutante, Kelvin decide partir após ver um comunicado de Gilbarian (Ulrich Tukur), seu grande amigo pessoal, solicitando sua ajuda na estação Prometheus por razões que não quer explicar. Ao chegar na estação orbital Kelvin tem uma dupla surpresa: Gilbarian se suicidou e os outros dois cientistas apresentam sintomas de stress extremo e paranóia, resultado dos exames que realizaram no planeta. É quando algo inusitado ocorre na vida de Kelvin e ele reencontra, bem à sua frente, sua amada Rheya.
O Quarteto Fantástico enfrenta o seu maior desafio quando o enigmático arauto intergaláctico Surfista Prateado vem preparar a Terra para a destruição.
Em busca de uma saída para evitar a destruição de seu planeta, seres extra-terrestres chegam à Terra. Eles possuem a forma de seres humanos, mas são bem menores. Para observar e aprender sobre a rotina terráquea eles passam a abrigar naves que tem o formato de humanos normais. Uma delas é Dave (Eddie Murphy), que precisa agir como uma pessoa normal para não despertar suspeitas.
Depois de uma viagem a Marte, o astronauta Patrick Ross, filho de um importante senador, Judson Ross, apresenta uma estranha mudança de comportamento. Algo misterioso aconteceu a bordo de sua nave. Infectado por um DNA alienígena, Ross tornou-se perigoso e letal e está a serviço de um plano alienígena para dominar a Terra propagando a espécie mortal alien usando algo que as mulheres não resistirão: o sexo. Para prevenir que o pior aconteça, se junta ao grupo de cientistas o clone de Sil, a alien do primeiro filme, agora chamada de Eve, que vive sob os cuidados deles num laboratório. Só que eles precisam agir rápido, já que Patrick começou a constituir suas primeiras crias em casulos nojentos dentro de um celeiro. Eve será usada como isca para deter o mais novo e perigoso predador sexual alienígena da Terra. Laura Baker, Press Lenox e Dennis Gamble, um astronauta que não foi infectado, correm atrás de Patrick antes que sua raça assole o nosso mundo, como fez com Marte.
Um piloto de um avião caça faz um voo de rotina quando é informado que um objeto estranho esta em seu caminho e ele resolve verificar do que se trata, mas seu avião acaba tendo uma pane e ele é obrigado a ejetar e vai acabar indo parar em uma pequena ilha no meio do pacifico. Lá ele vai acabar encontrando uma criatura estranha que deve ser um tipo de alien e que acaba sendo morta quando é atravessada por uma garra que o acerta por trás. O piloto não tem tempo de fugir e também acaba sendo morto. Algum tempo depois um nativo da pequena ilha é levado para a Guam para ser tratado de uns ferimentos e o Dr. Samuel Leon fica intrigado e quer descobrir a origem daqueles ferimentos e para isso monta um grupo com alguns mercenários, alguns nativos,um especialista em aranhas, uma expert em sobrevivência na selva e Mercer, uma piloto de avião que é justamente irmã do piloto que caiu na ilha.