לאחר שניצל מנסיון רצח ביריות, ג'יסון בורן איבד לחלוטין את זכרונו. נרדף ע"י רוצחיו , במרוץ נגד הזמן, בורן מגלה מהר מאוד שגם לו יש אינסטינקט להרוג. כעת, הוא מבין שעל מנת להציל את חייו עליו למצוא את זהותו. עלילה בינלאומית שנונה, מתח ללא הפסקה, מרדף מכוניות אדיר ברחבי פריס, פעלולים וקטעים מרשימים .
אב כנסיה פראנציסקני נוסע בלוויית נזיר צעיר אל מנזר בצפון איטליה במטרה לחקור פרשיית רצח שהתרחשה במקום. הנרצחים כולם הם אנשי כמורה הקשורים בדרך זו או אחרת לספריית המנזר. במהלך שהותם במקום מתרחשות רציחות נוספות וצמד הבלשים נאלץ לחדור לעולם אפוף מסתורין שבו משמשים בערבוביה דחפים מיניים ודתיים. הפקת ענק המצליחה להוציא אל הפועל משימה שעל פניה נראית בלתי אפשרית - לתרגם לשפת הקולנוע את הרומן של אומברטו אקו, שעיקרו מהויות הכתוב.
אדם (לי וואנדל) וד"ר לורנס גורדון מתעוררים בחדר חשוך ומוצאים עצמם כבולים לצינור בשני צידי חדר במרכז החדר גופת אדם המחזיק בידיו אקדח ורשמקול! שתי הודעות מוקלטות מגלות כי אשתו ובתו של גורדון נחטפו ויירצחו בשעה 6 בערבו של אותו יום... הדרך היחידה למנוע את הרצח הנורא היא - שגורדון ירצח את אדם לפני מועד זה... שניהם צריכים לשתף פעולה על מנת לגבור על מי ששבה אותם ולהציל את משפחתו של גורדון.
לאחר מותה של אחייניתה טומוקו, הכתבת רייקו שומעת סיפורים על קלטת שמי שצופה בה מת בדיוק שבוע לאחר הצפיה בה. רייקו לא מאמינה לשמועות בתחילה, אך לאחר שהיא לומדת את המקרה ורואה שגם החברה של טומוקו, מתה לאחר שבוע מרגע הצפייה בסרט, היא יוצאת לחקור את המסתורין מאחורי הקלטת. לאחר שהיא צופה בעצמה בקלטת, דברים מוזרים מתחילים לקרות, יחד עם בעלה לשעבר, שניהם מנסים לעצור את שעון המוות שהחל לתקתק שוב.
בשדותיו של הכומר גרהאם הס מתגלה בוקר אחד עיגול ענק ומסתורי שנוצר בנסיבות מסתוריות. בזמן שמתפתחת היסטריה תקשורתית ותיאוריות על חיזרים תופסות תאוצה, מנסים הכומר ובני משפחתו לגלות את האמת מאחורי התופעה ונאלצים להתמודד עם אמונתם. את הסרט כתב וביים מ. נייט שאמאיאן, האיש שמאחורי "החוש השישי" ושאר תופעות על טבעיות.
ג'יגסו ממשיך את המשחק הבא שלו על קבוצה של קורבנות חסרי מזל, שננעלו והוכרחו להרוג אחד את השני, בזמן שהבלש אריק מאסון מנסה לחסל אותו - בחוסר ידיעה שהמשחק מתקרב היישר לכיוונו.
יחד עם המתלמדת החדשה שלו, אמנדה, ג'יגסו מצליח להימלט פעם נוספת מידי המשטרה. בעוד השוטרים סורקים את העיר ללא הפסקה בניסיון לאתר אותו, ד"ר לין דנלון וידידו ג'ף אינם יודעים שעוד זמן קצר ימצאו עצמם כקורבנות החדשים של המסור במשחקו החולני הבא... הסרט המותח והמטריד ביותר בסדרה עד כה, "המסור 3" ישאיר אתכם עם פה פעור.
ג'יגסו והמתלמדת שלו מתו. כששני סוכני אפ.בי.איי מגלים על מותה של קרי, הם יוצאים לעזור לסוכנת פרז לפתור את המשחק והתעלומה האחרונה שהשאיר אחריו "ג'יגסו".