Juuri kun Val McKee ja Earl Basset päättävät jättää Perfectionin, Nevadan, alkaa kummallinen jyrinä, joka estää heidän lähtönsä. Hyvinkoulutetun seismologiopiskelijan avulla he huomaavat eristäytyneen kotikaupunkinsa olevan jättiläismäisten, ihmisiä syövien, maan alla elävien olioiden vierailun kohde.
Luutnantti Ripley on ainoa eloonjäänyt, kun hänen avaruusaluksensa putoaa vankilaplaneetta Fiorina 161:lle. Ripleyn pelko siitä, että Alien-hirviö oli aluksella, vahvistuu, kun vankien ruumiita alkaa löytyä. Ripleyn täytyy johtaa aseeton joukko taisteluun hirviötä vastaan. Pian hän huomaa jotain karmaisevaa omasta suhteestaan hirviöön.
Ellen Ripley kuoli taistellessaan täydellistä saalistajaa vastaan. Kaksisataa vuotta myöhemmin, kun hänelle on tehty kauhistuttavia kokeita, hän on jälleen elossa. Asekehittelyn yhteydessä tiedemiehet kloonaavat Ripleyn ja hänen sisällään uinuvan avaruusolennon. Ylösnoussut Ripley on täynnä yllätyksiä, kuten hänen sisällään oleva oliokin. Pian helvetti on irti. Voittaakseen olion Ripley liittoutuu salakuljettajien kanssa. Heidän joukossaan on Call -niminen mekaanikko, jolla on myös enemmän, kuin yksi yllätys takataskussaan.
Kate asuu tyttärensä Bethin kanssa syrjäisessä mökissä metsän keskellä. Mutta kun Kate saa ikäviä aavistuksia, hänen äidinvaistonsa joutuvat koetukselle.